| 查看: 1167 | 回复: 7 | ||
[求助]
恩,关于分子动力学模拟蛋白质侧链构象的问题,
|
|
我现在用分子动力学模拟一个蛋白质,其中有一个氨基酸对蛋白的活性非常关键,我想模拟这个氨基酸侧链在蛋白中,最佳的侧链构象(侧链的二面角分布等)和侧链在不同构象下变化所需要跨越的自由能能垒, 常规的分子动力学我觉得很难对所有的构象采样,所以问问大家有虾米好办法干这个事情没有.其实umbrella sampling方法也是一种，但是由于某些原因不能用这个方法， Locally enhanced sampling方法可行不，？。。各位大牛牛指点一下好不好啊，。。。  |
回复此楼» 猜你喜欢
323求调剂
已经有6人回复
-
一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂
已经有4人回复
-
352求调剂
已经有3人回复
-
一志愿东华大学化学070300，求调剂
已经有8人回复
-
277材料科学与工程080500求调剂
已经有7人回复
-
317求调剂
已经有18人回复
-
293求调剂
已经有5人回复
-
280分求调剂 一志愿085802
已经有7人回复
-
0854电子信息求调剂
已经有3人回复
-
263求调剂
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 分子动力学模拟长程库仑势的处理问题
已经有8人回复
- 【求助】关于分子动力学模拟疑惑
已经有6人回复
- 【讨论】关于汽液两相分子动力学模拟中粒子在汽液两相盒子交换的编程问题
已经有3人回复
- 【讨论】大家好，加水后跑完分子动力学，在log中发现了问题
已经有15人回复
- 【求助】关于vasp进行分子动力学模拟的求助
已经有12人回复
- 【求助】分子动力学模拟尺度问题？
已经有11人回复
- 【求助】关于用分子动力学来做光谱的问题
已经有14人回复
2楼2019-11-14 09:33:45
|
本帖内容被屏蔽 |
3楼2020-01-02 11:16:30
|
本帖内容被屏蔽 |
4楼2020-01-03 14:25:36
|
本帖内容被屏蔽 |
5楼2020-01-04 16:29:19
|
本帖内容被屏蔽 |
6楼2020-01-08 10:46:23
|
本帖内容被屏蔽 |
7楼2020-01-09 14:43:47
冷血孤峰
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 299.1
- 帖子: 241
- 在线: 27.6小时
- 虫号: 7226251
- 注册: 2017-09-24
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
8楼2020-05-19 08:51:00
10