| 查看: 1139 | 回复: 7 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
恩,关于分子动力学模拟蛋白质侧链构象的问题,
|
|||
|
我现在用分子动力学模拟一个蛋白质,其中有一个氨基酸对蛋白的活性非常关键,我想模拟这个氨基酸侧链在蛋白中,最佳的侧链构象(侧链的二面角分布等)和侧链在不同构象下变化所需要跨越的自由能能垒, 常规的分子动力学我觉得很难对所有的构象采样,所以问问大家有虾米好办法干这个事情没有.其实umbrella sampling方法也是一种，但是由于某些原因不能用这个方法， Locally enhanced sampling方法可行不，？。。各位大牛牛指点一下好不好啊，。。。  |
回复此楼» 猜你喜欢
招博士
已经有5人回复
-
青椒八年已不青，大家都被折磨成啥样了？
已经有6人回复
-
救命帖
已经有9人回复
-
青年基金C终止
已经有3人回复
-
26申博求博导推荐-遥感图像处理方向
已经有4人回复
-
限项规定
已经有7人回复
-
西南交通大学国家级人才团队2026年博士研究生招生（考核制）—机械、材料、力学方向
已经有3人回复
-
英文综述是否需要润色及查重
已经有5人回复
-
为什么nbs上溴 没有产物点出现呢
已经有9人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 分子动力学模拟长程库仑势的处理问题
已经有8人回复
- 【求助】关于分子动力学模拟疑惑
已经有6人回复
- 【讨论】关于汽液两相分子动力学模拟中粒子在汽液两相盒子交换的编程问题
已经有3人回复
- 【讨论】大家好，加水后跑完分子动力学，在log中发现了问题
已经有15人回复
- 【求助】关于vasp进行分子动力学模拟的求助
已经有12人回复
- 【求助】分子动力学模拟尺度问题？
已经有11人回复
- 【求助】关于用分子动力学来做光谱的问题
已经有14人回复
|
本帖内容被屏蔽 |
3楼2020-01-02 11:16:30
2楼2019-11-14 09:33:45
|
本帖内容被屏蔽 |
6楼2020-01-08 10:46:23
|
本帖内容被屏蔽 |
7楼2020-01-09 14:43:47