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嫘诺

新虫 (小有名气)

[求助] 转基因植株的RT-PCR结果分析

转基因水稻(日本晴)分子检测:提取经过农杆菌侵染法获得的转基因水稻在DNA水平上检测,获得了目的条带约1750bp,然后进行RT-PCR分析,结果如下图所示。问题:检测得到的非特异性条带约750bp,测序可知是目的基因的一部分,目的条带1750bp存在但不亮,问一下有哪位能帮解释下,这棵转基因苗是否可用?

RT-PCR结果
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可转到分子生物版发帖!
真相是最大的奢侈品
2楼2012-03-07 19:55:08
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wiln1

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
嫘诺(金币+10): 有帮助 4 2012-03-08 09:30:19
1.是不是提取过程中基因组被打断了,因为基因组在提取过程中和容易被打断,而被打断的部分恰好就是你的插入基因。
2.也有可能你构建的载体本身就有问题。
3楼2012-03-08 07:30:44
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脱水拂空

铜虫 (正式写手)

你可以再调一下退火温度 再看看 或者用LATaq 酶的两步法扩一下看看 转基因中存在着好多问题
4楼2012-03-08 10:31:03
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xiaoyur

金虫 (著名写手)

1.提高退火温度,2.重新设计特异引物,3.目标条带测序4.确定正常转录再做下一步。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
爱的反义词不是恨 而是冷漠!
5楼2012-03-10 08:36:38
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嫘诺

新虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by wiln1 at 2012-03-08 07:30:44:
1.是不是提取过程中基因组被打断了,因为基因组在提取过程中和容易被打断,而被打断的部分恰好就是你的插入基因。
2.也有可能你构建的载体本身就有问题。

谢谢!那我想问一下怎么样才能避免基因组被打断的情况发生呢?
这和载体有什么关系?
6楼2012-03-10 09:47:31
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嫘诺

新虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by 脱水拂空 at 2012-03-08 10:31:03:
你可以再调一下退火温度 再看看 或者用LATaq 酶的两步法扩一下看看 转基因中存在着好多问题

谢谢!退火温度已经提到60度了,已经很高了啊!LATaq酶两步法是什么方法?
7楼2012-03-10 09:48:59
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嫘诺

新虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by xiaoyur at 2012-03-10 08:36:38:
1.提高退火温度,2.重新设计特异引物,3.目标条带测序4.确定正常转录再做下一步。

谢谢!温度已经提高了啊!至于引物,因为我是接着师姐的做的,引物是她设计的应该没什么大问题!
8楼2012-03-10 09:56:06
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wiln1

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
SongQ5285(金币+3): 鼓励交流 2012-03-10 19:23:13
引用回帖:
6楼: Originally posted by 嫘诺 at 2012-03-10 09:47:31:
谢谢!那我想问一下怎么样才能避免基因组被打断的情况发生呢?
这和载体有什么关系?

避免提取过程中基因组被打断主要就是提取时混匀时要轻柔,不要太剧烈。提取完后跑一下胶。看看是不是一条带。
构建载体时,要是有的插入的不是基因全长,而是一段基因,也可能造成这种情况。还有插入的基因容易丢失。
9楼2012-03-10 11:55:44
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