| 查看: 6205 | 回复: 22 | ||||||||||||
| 本帖产生 1 个 CMEI ，点击这里进行查看 | ||||||||||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||||||||||
p452_1至尊木虫 (知名作家)
|
[交流]
回答网友关于单晶结构精修的问题 已有10人参与
|
|||||||||||
|
在shelxtl程序中，我用重原子法解 运行一次xp后 再运行一次xl 期间 我没有对相关原子进行指认 也没删除多余的q峰 只是继续xp、xl，让结构尽可能长全如此xp、xl重复三次，发现再运行xl时，出现以下的情况： 出现了无法继续精修的情况，而且这时再运行xp时 发现所有的q峰都没了 这是什么原因造成的？ 答案：这是q峰名字重复造成的。原子命名不可以重复。 下面回答你的疑问，供你参考： 1.是不是每次xp时 都要尽可能正确指认原子 删除多余 重复的q峰？如果不这样，而是等所有的原子都长出来，再指认和删q峰 运行xl时 会出现以上的问题？ 对的。每一次xp或者xshell时,都要指认化学正确的原子，命名，并且删除多余 重复的q峰。对于你认不准的q峰可以先不指认，保存好文件，再作进一步精修，这样就会长出新的q峰，有助于进一步原子指认，并且不会出现精修运行不下去的情况。 2.如果出现以上的情况 有没有方法补救和恢复？难道只能重新使用原始数据，再重头开始解吗？ 我一般做下一步，都保留好上一步的文件。如果出错，就可以到上一步的文件里进行修改。以前的（主要是res文件）文件保存好，就不需要重新使用原始数据，再重头开始解析。 3.是不是每次运行xp，无论保存与否，都要运行xl？ 这主要看你的运行xp的目的，如果你做了修改和变动，就需要保存文件和运行xl，这样才会改进你的结构模型。 4.怎样才能避免和预防出现xl无法运行的情况？ 减少马虎和尽量不犯错。有时候不合理的精修命令也会导致精修不稳定以致无法进行下去，这时候需要回到上一步的res or ins文件里，删除掉这个命令，保存文件再精修。 你在运行中碰到的问题，是可以避免的。你要明白，精修使用的文件是ins文件，精修后产生res文件，你每次需要打开xp或者xshell看图示结构，编辑和修改res文件，这些编辑包括原子命名，删除不合适的原子和多余的q峰，以及加入必要的精修命令等。编辑完毕后需要把res文件存成ins文件，进行下一步精修，这样又产生新的res文件。如此反复，不断改进，直到你认为自己的结构模型符合要求，一般符合要求的标志包括4项：残余峰小到（一般小于1）没有可以指认的原子（包括氢原子）; R1一般小于0.07; goof 趋近于1; 还有就是精修的最大偏差收敛趋近于0. 符合这4项，就可以加入氢键列表，（xcif）完善cif文件，（xcif）生成晶体结构参数表格，这时候结构精修才完成。 注意在下一轮精修之前，一定要删除多余的q峰，就不会发生你说的问题了。 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 单晶解析 | 科研工具 | 晶体 | 晶体解析相关 |
| 实用小知识、小细节 | 我的 | 晶体解析的方法和疑问 | 科研 |
| 淘帖 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
huahua1216» 猜你喜欢
在MOF中，有没有羧基参加配位的情况
已经有2人回复
-
招2026年入学上海交通大学博士生，急！！！
已经有1人回复
-
无机化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有257人回复
-
理论计算合作
已经有0人回复
-
求高校合作
已经有1人回复
-
27级无机化学申博自荐
已经有2人回复
-
Chemdraw免费软件
已经有0人回复
-
单晶结构解析，各类疑难晶体数据处理和答疑
已经有38人回复
-
这个水相反应有没有催化剂促进发生
已经有4人回复
-
Mn Me3TACN
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求高手帮忙精修一下单晶
已经有15人回复
- 晶体结构精修及解析资料大全+精修解析软件（钱逸泰 陈小明等）
已经有416人回复
- 求解析晶体结构，单晶or多晶？
已经有15人回复
- SnO2-fullprof精修问题
已经有9人回复
- 中子衍射图精修
已经有13人回复
- 一个单晶结构的判断，很有意思的
已经有9人回复
- 只知道单胞参数和组成晶体的分子的结构，不知道单晶结构时，如何用MS构建晶体模型？
已经有7人回复
- fullprof 结构精修。有点抓狂，求帮助！！！
已经有7人回复
- 关于降温长单晶的问题
已经有14人回复
- 荧光粉的结构精修图怎么做出来的啊？
已经有4人回复
- 交流：晶体结构精修完了，生成完整的晶体结构报表指南
已经有18人回复
- SHELXL 可以用作粉末多晶xrd结果精修吗？
已经有6人回复
- 40金悬赏解决一个孪晶问题，单晶结构精修。。。。
已经有7人回复
- 【求助】求助精修过程中出现ARRAY B TOO SMALL FOR THIS PROBLEM
已经有4人回复
- 【求助】投稿回信中的单晶结构问题？？？急！！
已经有11人回复
- 【求助】关于用GSAS做Rietveld精修的问题
已经有17人回复
- 【求助】关于升华法制备单晶的问题
已经有8人回复
- 【求助】请问单晶结构自动旋转的软件
已经有6人回复
- 【请教】各位大仙，关于方解石单晶的一个问题。
已经有6人回复
- 【求助】关于判断正反尖晶石结构的问题
已经有13人回复
- 【请教】结构精修两个错误的解决方法 Maximum Shift/Error
已经有4人回复
- 【求助】帮忙精修一个晶体结构
已经有4人回复
sea6002
木虫 (正式写手)
- 应助: 17 (小学生)
- 金币: 1770.3
- 散金: 20
- 红花: 2
- 帖子: 674
- 在线: 79.9小时
- 虫号: 582734
- 注册: 2008-07-25
- 性别: GG
- 专业: 色谱分析
10楼2012-03-24 13:25:16
huahua1216
至尊木虫 (文坛精英)
- CMEI: 1
- 应助: 173 (高中生)
- 贵宾: 1.712
- 金币: 40654.7
- 散金: 1124
- 红花: 22
- 沙发: 1
- 帖子: 15431
- 在线: 449.5小时
- 虫号: 260203
- 注册: 2006-06-17
- 性别: GG
- 专业: 放射分析
2楼2012-03-05 08:24:19
abcd007140
铁杆木虫 (著名写手)
小木虫首席软件技术总监
- 应助: 2 (幼儿园)
- 贵宾: 0.306
- 金币: 6977.1
- 散金: 416
- 红花: 25
- 沙发: 9
- 帖子: 2915
- 在线: 781.4小时
- 虫号: 346502
- 注册: 2007-04-15
- 性别: GG
- 专业: 有机合成
3楼2012-03-05 08:49:56
ylt
木虫 (著名写手)
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 3536.4
- 散金: 2453
- 红花: 3
- 帖子: 1485
- 在线: 849.6小时
- 虫号: 614949
- 注册: 2008-09-28
- 性别: GG
- 专业: 涂料
5楼2012-03-05 11:52:12
5
