24小时热门版块排行榜

>论坛更新日志 (3284)
>虫友互识 (268)
>文献求助 (232)
>导师招生 (157)
>硕博家园 (104)
>休闲灌水 (73)
>考博 (71)
>论文道贺祈福 (57)
>招聘信息布告栏 (54)
>博后之家 (47)
>考研 (45)
>教师之家 (43)
>公派出国 (43)
>论文投稿 (41)
>基金申请 (37)
>找工作 (28)

返回列表

本帖产生 1 个 CMEI ，点击这里进行查看

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

p452_1

至尊木虫 (知名作家)

CMEI: 7
应助: 456 (硕士)
金币: 27334.4
散金: 97
红花: 86
帖子: 5993
在线: 1895.1小时
虫号: 1575142
注册: 2012-01-12
性别: GG
专业: 无机合成和制备化学

[交流] 回答网友关于单晶结构精修的问题已有10人参与

在shelxtl程序中，我用重原子法解运行一次xp后再运行一次xl 期间我没有对相关原子进行指认也没删除多余的q峰只是继续xp、xl，让结构尽可能长全如此xp、xl重复三次，发现再运行xl时，出现以下的情况：

出现了无法继续精修的情况，而且这时再运行xp时发现所有的q峰都没了
这是什么原因造成的？

答案：这是q峰名字重复造成的。原子命名不可以重复。

下面回答你的疑问，供你参考：

1.是不是每次xp时都要尽可能正确指认原子删除多余重复的q峰？如果不这样，而是等所有的原子都长出来，再指认和删q峰运行xl时会出现以上的问题？

对的。每一次xp或者xshell时,都要指认化学正确的原子，命名，并且删除多余重复的q峰。对于你认不准的q峰可以先不指认，保存好文件，再作进一步精修，这样就会长出新的q峰，有助于进一步原子指认，并且不会出现精修运行不下去的情况。
2.如果出现以上的情况有没有方法补救和恢复？难道只能重新使用原始数据，再重头开始解吗？

我一般做下一步，都保留好上一步的文件。如果出错，就可以到上一步的文件里进行修改。以前的（主要是res文件）文件保存好，就不需要重新使用原始数据，再重头开始解析。

3.是不是每次运行xp，无论保存与否，都要运行xl？

这主要看你的运行xp的目的，如果你做了修改和变动，就需要保存文件和运行xl，这样才会改进你的结构模型。

4.怎样才能避免和预防出现xl无法运行的情况？

减少马虎和尽量不犯错。有时候不合理的精修命令也会导致精修不稳定以致无法进行下去，这时候需要回到上一步的res or ins文件里，删除掉这个命令，保存文件再精修。

你在运行中碰到的问题，是可以避免的。你要明白，精修使用的文件是ins文件，精修后产生res文件，你每次需要打开xp或者xshell看图示结构，编辑和修改res文件，这些编辑包括原子命名，删除不合适的原子和多余的q峰，以及加入必要的精修命令等。编辑完毕后需要把res文件存成ins文件，进行下一步精修，这样又产生新的res文件。如此反复，不断改进，直到你认为自己的结构模型符合要求，一般符合要求的标志包括4项：残余峰小到（一般小于1）没有可以指认的原子（包括氢原子）; R1一般小于0.07; goof 趋近于1; 还有就是精修的最大偏差收敛趋近于0. 符合这4项，就可以加入氢键列表，（xcif）完善cif文件，（xcif）生成晶体结构参数表格，这时候结构精修才完成。

注意在下一轮精修之前，一定要删除多余的q峰，就不会发生你说的问题了。

回复此楼