| 查看: 13084 | 回复: 11 | ||
[求助]
求问：解读NCBI 保守结构域分析结果
|
||
|
由于基础知识薄弱，利用NCBI中的conserved domain search 工具分析一蛋白序列结果后，对显示的结果看不大明白。向各位求教，望多多相助并详细解答，谢谢！ 分析结果如附件显示，请问： 1.分析结果中的sepcific hits 指的是什么？ 2.分析结果中的superfamilies指的是什么？为什么一段序列会出现多个家族的 信息？superfamilies这一行中第二个TPP-enzym跟TPP-enzymes不一样吗？ 3.Multi-domains中文含义又指的是什么？为什么在NCBI上分别用blastp搜索后的结果跟专用conserved domains 程序搜索后该行显示的数据不一致呢？ 4.用专业的语言怎样准确分析图片中的结果呢？ 今天搜索了几篇文献，看了后感觉表述也不是太清楚。 问题比较多，也比较啰嗦，望多多相助！  blastp搜索出来的结果  conserved domains工具搜索出来的结果 |
回复此楼» 猜你喜欢
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有109人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
-
氢氧化钾活化操作
已经有18人回复
-
散金
已经有68人回复
-
生物质超级电容器
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 气相色谱检测过程中遇到问题，怎么解决？
已经有7人回复
- 关于植物消解的几个问题
已经有4人回复
- 基因测序领域Walkman：迷你型基因检测设备MinION发布
已经有5人回复
- DNA合成单如何解读？请教！
已经有3人回复
- 红外分析，带结构式
已经有8人回复
- 请问有福建中医药大学有机化学、分析化学、药理学的PPT
已经有3人回复
- 向NCBI提交序列问题
已经有8人回复
- 求助：对于一个化合物用液相分析的时候，流动相该怎么选择？
已经有3人回复
- 提问-ncbi 序列修改
已经有4人回复
- 求助：怎样向NCBI提交发现的SNP新位点
已经有6人回复
- 【求助/交流】如何用NCBI的BLAST来找到一个基因的保守序列?
已经有11人回复
- 【求助/交流】NCBI上注册基因序列，没有ACCESSION NUMEBER是怎么回事？谢谢
已经有6人回复
- 【求助/交流】NCBI给了我登录号但是用号查不到，这样算不算登录成功呢？
已经有8人回复
- 【求助/交流】请教一个NCBI上注释的问题
已经有5人回复
- 【求助/交流】关于ncbi上比对结果的问题
已经有6人回复
- NCBI blast 结果一些参数的含义求高手指点
已经有12人回复
wanhscn
木虫 (职业作家)
哲学@草根
- MolEPI: 26
- 应助: 53 (初中生)
- 贵宾: 0.87
- 金币: 3895.7
- 散金: 877
- 红花: 27
- 沙发: 14
- 帖子: 3642
- 在线: 526.2小时
- 虫号: 1376762
- 注册: 2011-08-22
- 性别: GG
- 专业: 植物遗传学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木(金币+2, 专家考核): 一如既往的仰慕ing 2012-03-07 16:39:22
vvkaka(金币+5): ★★★很有帮助 2012-03-08 23:50:07
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木(金币+2, 专家考核): 一如既往的仰慕ing 2012-03-07 16:39:22
vvkaka(金币+5): ★★★很有帮助 2012-03-08 23:50:07
|
superfamilies 一个是 TPP_enzymes 还有一个是TPP_enzyme_PYR 两个不一样，后面那个包含了 PYR/PP interface 结构域 sepcific hits 你所blast的具体可能是什么蛋白，superfamilies 就是说你这个蛋白有可能属于哪个家族或者超家族，Multidomain说明该蛋白是 Multidomain 蛋白，这是个由小到大的范围，就好像是生物的分类：种 属 科 目 纲 门 界。 蛋白中，随着时间不断进化组合，如今大部分蛋白属于 Multidomain 蛋白。 至于编号为什么不一样，可能是系统编号不一样，有可能其对应的Multidomain 蛋白 分类是一样的，或者未知！ |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
vvkaka
7楼2012-03-07 14:08:28
2楼2012-03-05 15:03:25
3楼2012-03-05 21:27:30
西瓜
荣誉版主 (知名作家)
- MolEPI: 50
- 应助: 94 (初中生)
- 贵宾: 3.157
- 金币: 1849.6
- 散金: 11458
- 红花: 116
- 沙发: 21
- 帖子: 7553
- 在线: 1449.5小时
- 虫号: 271749
- 注册: 2006-08-13
- 性别: GG
- 专业: 细胞衰老
- 管辖: 分子生物
4楼2012-03-06 10:38:45
5楼2012-03-06 11:53:13
6楼2012-03-07 09:05:12
8楼2012-03-08 23:50:44
9楼2012-05-20 08:32:58
10楼2016-01-17 22:13:33
