| 查看: 7869 | 回复: 18 | |||||||||||||||||||
| 本帖产生 1 个 CMEI ，点击这里进行查看 | |||||||||||||||||||
p452_1至尊木虫 (知名作家)
|
[交流]
交流：晶体结构精修完了，生成完整的晶体结构报表指南 已有16人参与
|
||||||||||||||||||
|
有些同学和同事，晶体结构解析完成了，却受困惑于怎样生成完整的晶体结构报表。完整的结构参数表格是主要根据cif文件生成的，所以要想有完整的晶体结构报表，之前必须要首先产生尽量完整的cif文件。要想通过xcif产生完整的结构参数表格，需要做好以下几步： 1、最好在单晶收衍射数据设置时候，就把晶体的形状、颜色、大小尺寸和测试温度输入进去，这样产生的p4p文件里会自动记录下这些有用的信息，在解析晶体结构时候，生成的pcf文件里就会存有这些信息。另外，这些信息的录入对正确地吸收校正原始衍射数据有好处。 2、首先需要在ins文件中加入几行关于结构参数的指令如下： acta (生成cif文件) bond $H（所有键长键角，包括H的） conf（关于扭转角的） htab (关于氢键的) SIZE (晶体的大小尺寸) TEMP (测试温度) 等等，如果需要更多的结构参数列表，还需要加入相关的命令，保存。 3、使用这个ins文件进行精修，注意精修的最大偏差归零，产生新的cif文件。 4、编辑pcf文件。首先检查对称性和空间群是否正确，然后检查晶体的形状、颜色和大小尺寸，还有测试温度，以及试验的密度，如果不对或者为零的，需要填写。一般试验的密度那一行填写‘？’表示你没有测试密度，吸收校正那一行，可以填写‘multi-scan’，你可以根据自己做的吸收校正类型进行填写。 5、pcf文件主要用来在Xcif中改写cif文件，补充cif文件中必须要填写的信息。这个操作是Xcif中的 'C' 选项，需要先做，基本上follow电脑上出现的选项即可。 6、下面作结构参数表格，是Xcif中的 'T' 选项，需要使用cif文件和数据文件（与cif文件名字相同）。 7、需要根据要求，首先给出结构表格的名称。注意扩展名可以选择rtf或者tex，然后一步，对应于rtf文件，需要选择rta格式；如果是tex格式，就要选择ang或者def格式。然后根据自己的需要，在各种结构表格选项后选择Yes或者No，生成结构参数表格，最后选择退出Xcif即可。 8、结构参数表格的rtf文件容易出错，比如氢键列表，如果在ins文件中，虽然给出了htab命令，但是没有给出具体的每个氢键根据对称操作的列表，那么在cif文件中就不会有对应的具体氢键列出来。这样在结构表格选项的最后一项是氢键列表，选择No可以，如果选择Yes就会出错，导致生成的结构参数表格打不开，所以一定要避免。 以上列出的几点操作和注意事项属于个人经验，欢迎专家和爱好者多来交流，批评指正。 [ Last edited by p452_1 on 2012-2-27 at 02:30 ] |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 光催化专辑 | 初学晶体 | 单晶解析 | 科研工具 |
| GSAS结构精修 | 晶体解析相关 | 初学晶体--单晶&共晶 | 晶体解析 |
| 晶体解析的方法和疑问 | 好帖子 | 加油站 | 我的 |
| 晶体方面 | 写作 | 结构解析 | 好帖收录 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
» 猜你喜欢
台州学院有序多孔材料团队最后冲刺，同学们别错过哦，请速联系！
已经有0人回复
-
江西科技师范大学物理化学课题组接收调剂生，名额还有，速来
已经有0人回复
-
无机化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有82人回复
-
求碳酸钠和碳酸氢钠的晶胞结构图或晶体结构图
已经有0人回复
-
求碳酸钠和碳酸氢钠的晶胞结构图或晶体结构图
已经有0人回复
-
江西科技师范大学物理化学课题组接收调剂生，12点开启，速来
已经有0人回复
-
【2026 考研调剂】哈尔滨工程大学 招收学硕调剂生（英语一、数学一）
已经有0人回复
-
四川轻化工大学化学与环境工程学院 付昱教授课题组招收调剂硕士研究生
已经有11人回复
-
盐城工学院材料科学与工程学院调剂
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 中子衍射图精修
已经有13人回复
- 晶体结构的表达
已经有12人回复
- 晶体结构精修-晶体学者的SHELXL软件指南”中文版
已经有694人回复
- 关于晶体结构精修的审稿意见的求助
已经有7人回复
- 交流：水上加氢原子精修讨论
已经有37人回复
- 求晶体结构数据参数（Al-6.6Si-0.36Mg铝合金）
已经有6人回复
- Water Research第二篇又是大修，求有经验虫子解惑。
已经有7人回复
- 回答网友关于单晶结构精修的问题
已经有22人回复
- N-甲基哌啶在什么条件下易生成氮上结合一个氢并带一个正电荷？
已经有6人回复
- 生物转化生成新产物另加MTT实验检测药理活性，发哪个杂志比较好？
已经有6人回复
- 预测晶体结构的软件：XtalOpt
已经有28人回复
- 【求助】晶体结构4H-SiC参数
已经有14人回复
- 【交流】长晶体的经验(转载)
已经有26人回复
- 【求助】关于使用CDI生成不对称二苯脲
已经有6人回复
- 【分享】晶体结构精修——晶体学者的SHELXL软件指南
已经有29人回复
- 【请教】结构精修两个错误的解决方法 Maximum Shift/Error
已经有4人回复
p452_1
至尊木虫 (知名作家)
- CMEI: 7
- 应助: 456 (硕士)
- 金币: 27334.4
- 散金: 97
- 红花: 86
- 帖子: 5993
- 在线: 1895.1小时
- 虫号: 1575142
- 注册: 2012-01-12
- 性别: GG
- 专业: 无机合成和制备化学
9楼2012-02-27 16:15:27
mashulin
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 132 (高中生)
- 金币: 5434.7
- 散金: 20
- 红花: 4
- 帖子: 686
- 在线: 144.7小时
- 虫号: 297239
- 注册: 2006-11-18
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
2楼2012-02-27 05:59:24
sunjing120
铁杆木虫 (小有名气)
老太太
- 应助: 22 (小学生)
- 金币: 7482.2
- 散金: 12
- 帖子: 260
- 在线: 153.5小时
- 虫号: 465780
- 注册: 2007-11-23
- 性别: MM
- 专业: 有机合成
3楼2012-02-27 08:29:35
送鲜花一朵
 |
4楼2012-02-27 08:35:34
wjh522996
银虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 374.5
- 帖子: 335
- 在线: 183.7小时
- 虫号: 72623
- 注册: 2005-06-05
- 性别: MM
- 专业: 爆炸与冲击动力学
5楼2012-02-27 08:41:33
abcd007140
铁杆木虫 (著名写手)
小木虫首席软件技术总监
- 应助: 2 (幼儿园)
- 贵宾: 0.306
- 金币: 6977.1
- 散金: 416
- 红花: 25
- 沙发: 9
- 帖子: 2915
- 在线: 781.4小时
- 虫号: 346502
- 注册: 2007-04-15
- 性别: GG
- 专业: 有机合成
6楼2012-02-27 08:49:15
 |
7楼2012-02-27 10:42:08
朱瑞敏
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1918.2
- 散金: 73
- 红花: 1
- 帖子: 144
- 在线: 143小时
- 虫号: 623099
- 注册: 2008-10-11
- 性别: MM
- 专业: 光化学和辐射化学
8楼2012-02-27 10:49:58
Daoyong
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 13428.2
- 红花: 3
- 帖子: 1591
- 在线: 163.3小时
- 虫号: 857468
- 注册: 2009-09-26
- 性别: GG
- 专业: 光谱分析
10楼2012-05-16 21:31:38
