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【奖励】 本帖被评价24次,作者valenhou001增加金币 18.6

[资源] 预测晶体结构的软件:XtalOpt

XtalOpt是David C. Lonie和Eva Zurek基于开源模式发布的一套采用进化算法(evolutionary algorithm)并结合DFT计算程序或经典势的分子模拟程序来预测晶体结构的软件。该软件并结合图形界面软件Avogadro,操作方便。

XtalOpt的主页及下载地址:http://xtalopt.openmolecules.net/wiki/index.fcgi/
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★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常感谢侯老师~
3楼2011-05-12 10:50:52
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★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常感谢,3x
4楼2011-05-12 11:20:21
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★★★★★ 五星级,优秀推荐

用用看。
5楼2011-05-12 11:26:21
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★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常感谢侯老师

试试
6楼2011-05-12 11:52:22
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★★★★★ 五星级,优秀推荐

学习学习 表示暂没看到用的它的文献。
7楼2011-05-12 12:32:51
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

先用用看看……感谢分享……
8楼2011-05-12 15:17:39
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★ ★
youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-05-12 17:02:12
引用回帖:
Originally posted by youzhizhe at 2011-05-12 12:32:51:
学习学习 表示暂没看到用的它的文献。

这篇JACS章就用到了XtalOpt.
Benzene under high pressure: a story of molecular crystals transforming
to saturated networks, with a possible intermediate metallic phase
Xiao-Dong Wen, Roald Hoffmann, and N. W. Ashcroft
J. Am. Chem. Soc., Just Accepted Manuscript • DOI: 10.1021/ja201786y • Publication Date (Web): 27 April 2011
Downloaded from http://pubs.acs.org on May 11, 2011
http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ja201786y
9楼2011-05-12 15:39:52
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xiao72379

木虫 (正式写手)


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学习  备用   现在还没有涉及过用计算的方法预测晶体结构
10楼2011-05-12 15:44:51
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★★★★★ 五星级,优秀推荐

学习了
12楼2011-05-12 17:08:47
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freer007

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

感谢分享,了解一下
13楼2011-05-13 08:43:57
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xiaoxiao6726

银虫 (初入文坛)


★★★ 三星级,支持鼓励

感谢了再看
15楼2011-05-14 20:10:23
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★★★★★ 五星级,优秀推荐

链接不上服务器呀!总是提示输入密码就是登不进去
16楼2011-05-15 14:30:27
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其实做晶体结构预测,经验还是很重要的。
而且还需要好的物理思想。
17楼2011-05-15 15:42:11
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weilh

铁杆木虫 (著名写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

很难用吧似乎?
18楼2011-05-15 15:54:09
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berain

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

强大~~~
19楼2011-05-15 16:09:39
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lzllzl

木虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

引用回帖:
Originally posted by 贺仪 at 2011-05-15 14:30:27:
链接不上服务器呀!总是提示输入密码就是登不进去

我的也是同样的提示,输入密码仍进不去。不知你的解决没有。
20楼2011-06-03 17:46:27
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引用回帖:
Originally posted by lzllzl at 2011-06-03 17:46:27:
我的也是同样的提示,输入密码仍进不去。不知你的解决没有。

没解决呢 不知道怎么弄……
21楼2011-06-04 09:12:05
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louiexp

金虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常感谢
22楼2011-06-05 14:42:07
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★★★★★ 五星级,优秀推荐

引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2011-05-12 10:28:56:
XtalOpt是David C. Lonie和Eva Zurek基于开源模式发布的一套采用进化算法(evolutionary algorithm)并结合DFT计算程序或经典势的分子模拟程序来预测晶体结构的软件。该软件并结合图形界面软件Avogadro,操作方便。 ...

感谢侯老师,顺便一问,USPEX跟XtalOpt相比,都有什么异同呢?USPEX也是用于预测给定条件和化学式的晶体结构的,并且也可以与VASP,PWscf等通过接口交换数据。
USPEX的地址:http://han.ess.sunysb.edu/~USPEX/
23楼2011-07-12 21:03:57
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cocolv

木虫 (正式写手)


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非常感谢侯老师!先收藏了。
24楼2011-07-13 10:50:30
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llg1987

金虫 (知名作家)


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非常感谢
25楼2011-12-19 15:21:48
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endeavor2

新虫 (小有名气)


★★★ 三星级,支持鼓励

谢谢侯老师!!
26楼2012-04-22 10:04:43
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分子动力轩

铁虫 (小有名气)


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老师您好,我想请教一下我在使用这个软件的时候总是无法生成一代结构,总是反复的重启任务,并说Qprocess code error:5这是什么情况呢?
27楼2012-08-23 15:28:48
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huangxing831020

新虫 (初入文坛)


链接不上服务器呀!能不能发一份,谢谢。huangxing831020@126.com
28楼2013-12-30 09:14:12
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胸毛100根

新虫 (小有名气)


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请问老师这个软件免费使用吗?
29楼2016-02-12 22:50:12
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简单回复
2011-05-12 10:31   回复  
五星好评  
djkj11楼
2011-05-12 16:51   回复  
五星好评  谢谢分享。
sg1840892614楼
2011-05-13 11:52   回复  
五星好评  
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