24小时热门版块排行榜    

查看: 8544  |  回复: 28
【奖励】 本帖被评价24次,作者valenhou001增加金币 18.6

[资源] 预测晶体结构的软件:XtalOpt

XtalOpt是David C. Lonie和Eva Zurek基于开源模式发布的一套采用进化算法(evolutionary algorithm)并结合DFT计算程序或经典势的分子模拟程序来预测晶体结构的软件。该软件并结合图形界面软件Avogadro,操作方便。

XtalOpt的主页及下载地址:http://xtalopt.openmolecules.net/wiki/index.fcgi/
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常感谢侯老师~
3楼2011-05-12 10:50:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常感谢,3x
4楼2011-05-12 11:20:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

★★★★★ 五星级,优秀推荐

用用看。
5楼2011-05-12 11:26:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常感谢侯老师

试试
6楼2011-05-12 11:52:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

★★★★★ 五星级,优秀推荐

学习学习 表示暂没看到用的它的文献。
7楼2011-05-12 12:32:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cg陈

铁杆木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

先用用看看……感谢分享……
8楼2011-05-12 15:17:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
★ ★
youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-05-12 17:02:12
引用回帖:
Originally posted by youzhizhe at 2011-05-12 12:32:51:
学习学习 表示暂没看到用的它的文献。

这篇JACS章就用到了XtalOpt.
Benzene under high pressure: a story of molecular crystals transforming
to saturated networks, with a possible intermediate metallic phase
Xiao-Dong Wen, Roald Hoffmann, and N. W. Ashcroft
J. Am. Chem. Soc., Just Accepted Manuscript • DOI: 10.1021/ja201786y • Publication Date (Web): 27 April 2011
Downloaded from http://pubs.acs.org on May 11, 2011
http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ja201786y
9楼2011-05-12 15:39:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiao72379

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

学习  备用   现在还没有涉及过用计算的方法预测晶体结构
10楼2011-05-12 15:44:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

★★★★★ 五星级,优秀推荐

学习了
12楼2011-05-12 17:08:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

freer007

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

感谢分享,了解一下
13楼2011-05-13 08:43:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoxiao6726

银虫 (初入文坛)


★★★ 三星级,支持鼓励

感谢了再看
15楼2011-05-14 20:10:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

★★★★★ 五星级,优秀推荐

链接不上服务器呀!总是提示输入密码就是登不进去
16楼2011-05-15 14:30:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
其实做晶体结构预测,经验还是很重要的。
而且还需要好的物理思想。
17楼2011-05-15 15:42:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

weilh

铁杆木虫 (著名写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

很难用吧似乎?
18楼2011-05-15 15:54:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

berain

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

强大~~~
19楼2011-05-15 16:09:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lzllzl

木虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

引用回帖:
Originally posted by 贺仪 at 2011-05-15 14:30:27:
链接不上服务器呀!总是提示输入密码就是登不进去

我的也是同样的提示,输入密码仍进不去。不知你的解决没有。
20楼2011-06-03 17:46:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
引用回帖:
Originally posted by lzllzl at 2011-06-03 17:46:27:
我的也是同样的提示,输入密码仍进不去。不知你的解决没有。

没解决呢 不知道怎么弄……
21楼2011-06-04 09:12:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

louiexp

金虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常感谢
22楼2011-06-05 14:42:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

★★★★★ 五星级,优秀推荐

引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2011-05-12 10:28:56:
XtalOpt是David C. Lonie和Eva Zurek基于开源模式发布的一套采用进化算法(evolutionary algorithm)并结合DFT计算程序或经典势的分子模拟程序来预测晶体结构的软件。该软件并结合图形界面软件Avogadro,操作方便。 ...

感谢侯老师,顺便一问,USPEX跟XtalOpt相比,都有什么异同呢?USPEX也是用于预测给定条件和化学式的晶体结构的,并且也可以与VASP,PWscf等通过接口交换数据。
USPEX的地址:http://han.ess.sunysb.edu/~USPEX/
23楼2011-07-12 21:03:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cocolv

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常感谢侯老师!先收藏了。
24楼2011-07-13 10:50:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

llg1987

金虫 (知名作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常感谢
25楼2011-12-19 15:21:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

endeavor2

新虫 (小有名气)


★★★ 三星级,支持鼓励

谢谢侯老师!!
26楼2012-04-22 10:04:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

分子动力轩

铁虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

老师您好,我想请教一下我在使用这个软件的时候总是无法生成一代结构,总是反复的重启任务,并说Qprocess code error:5这是什么情况呢?
27楼2012-08-23 15:28:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huangxing831020

新虫 (初入文坛)


链接不上服务器呀!能不能发一份,谢谢。huangxing831020@126.com
28楼2013-12-30 09:14:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

胸毛100根

新虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

请问老师这个软件免费使用吗?
29楼2016-02-12 22:50:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
2011-05-12 10:31   回复  
五星好评  
djkj11楼
2011-05-12 16:51   回复  
五星好评  谢谢分享。
sg1840892614楼
2011-05-13 11:52   回复  
五星好评  
相关版块跳转 我要订阅楼主 valenhou001 的主题更新
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +27 医学老男孩 2026-08-13 58/2900 2026-08-15 15:57 by GZUZM
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +7 Ldrop2023 2026-08-13 7/350 2026-08-15 15:57 by mzhh2000
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 P4JhWrbJGjSe 2026-08-14 5/250 2026-08-15 15:46 by QXtWNz7PI7wZ
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 14:58 by QXtWNz7PI7wZ
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 7lpolszZVXgi 2026-08-14 3/150 2026-08-15 14:53 by QXtWNz7PI7wZ
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +7 majunge000 2026-08-11 9/450 2026-08-15 13:34 by kiz2011
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 3/150 2026-08-15 12:33 by KxMI1BYBxWX1
[考研] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 7lpolszZVXgi 2026-08-14 8/400 2026-08-15 11:53 by KxMI1BYBxWX1
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 04:45 by 4wMiSEwB6436
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 4/200 2026-08-15 04:17 by 4wMiSEwB6436
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-15 00:16 by 4wMiSEwB6436
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-14 22:32 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
信息提示
请填处理意见