| 查看: 6120 | 回复: 18 | |||
| 本帖产生 1 个 CMEI ，点击这里进行查看 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
p452_1至尊木虫 (知名作家)
|
[交流]
交流：晶体结构精修完了，生成完整的晶体结构报表指南已有16人参与
|
||
|
有些同学和同事，晶体结构解析完成了，却受困惑于怎样生成完整的晶体结构报表。完整的结构参数表格是主要根据cif文件生成的，所以要想有完整的晶体结构报表，之前必须要首先产生尽量完整的cif文件。要想通过xcif产生完整的结构参数表格，需要做好以下几步： 1、最好在单晶收衍射数据设置时候，就把晶体的形状、颜色、大小尺寸和测试温度输入进去，这样产生的p4p文件里会自动记录下这些有用的信息，在解析晶体结构时候，生成的pcf文件里就会存有这些信息。另外，这些信息的录入对正确地吸收校正原始衍射数据有好处。 2、首先需要在ins文件中加入几行关于结构参数的指令如下： acta (生成cif文件) bond $H（所有键长键角，包括H的） conf（关于扭转角的） htab (关于氢键的) SIZE (晶体的大小尺寸) TEMP (测试温度) 等等，如果需要更多的结构参数列表，还需要加入相关的命令，保存。 3、使用这个ins文件进行精修，注意精修的最大偏差归零，产生新的cif文件。 4、编辑pcf文件。首先检查对称性和空间群是否正确，然后检查晶体的形状、颜色和大小尺寸，还有测试温度，以及试验的密度，如果不对或者为零的，需要填写。一般试验的密度那一行填写‘？’表示你没有测试密度，吸收校正那一行，可以填写‘multi-scan’，你可以根据自己做的吸收校正类型进行填写。 5、pcf文件主要用来在Xcif中改写cif文件，补充cif文件中必须要填写的信息。这个操作是Xcif中的 'C' 选项，需要先做，基本上follow电脑上出现的选项即可。 6、下面作结构参数表格，是Xcif中的 'T' 选项，需要使用cif文件和数据文件（与cif文件名字相同）。 7、需要根据要求，首先给出结构表格的名称。注意扩展名可以选择rtf或者tex，然后一步，对应于rtf文件，需要选择rta格式；如果是tex格式，就要选择ang或者def格式。然后根据自己的需要，在各种结构表格选项后选择Yes或者No，生成结构参数表格，最后选择退出Xcif即可。 8、结构参数表格的rtf文件容易出错，比如氢键列表，如果在ins文件中，虽然给出了htab命令，但是没有给出具体的每个氢键根据对称操作的列表，那么在cif文件中就不会有对应的具体氢键列出来。这样在结构表格选项的最后一项是氢键列表，选择No可以，如果选择Yes就会出错，导致生成的结构参数表格打不开，所以一定要避免。 以上列出的几点操作和注意事项属于个人经验，欢迎专家和爱好者多来交流，批评指正。 [ Last edited by p452_1 on 2012-2-27 at 02:30 ] |
回复此楼» 本帖已获得的红花（最新10朵）
» 猜你喜欢
求助MIL-125(Ti)的CIF 文件
已经有1人回复
-
美国 Tufts University, Yu Zhang课题组博士后招聘（金属有机/无机合成及催化）
已经有10人回复
-
无机化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有216人回复
-
中原工学院邵志超副教授课题组招收调剂生2名
已经有0人回复
-
我校 有两个085601 材料工程调剂名额
已经有0人回复
-
求博导推荐和带走
已经有1人回复
-
求助下载两个cif文件，ccdc：2193452，2307399
已经有0人回复
-
深圳信息职业技术学院2024年外籍教师招聘公告
已经有0人回复
-
20金币求助CIF文件
已经有0人回复
-
请教，Diamond能不能测任意两个化学键的夹角？
已经有1人回复
-
50金币帮忙下载间苯二甲酸分子的晶体cif文件和CCDC号
已经有1人回复
送鲜花一朵
 感谢分享 |
12楼2012-12-13 21:51:43
sunjing120
铁杆木虫 (小有名气)
老太太
- 应助: 22 (小学生)
- 金币: 7312.2
- 散金: 12
- 帖子: 260
- 在线: 153.5小时
- 虫号: 465780
- 注册: 2007-11-23
- 性别: MM
- 专业: 有机合成
3楼2012-02-27 08:29:35
朱瑞敏
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1918.2
- 散金: 73
- 红花: 1
- 帖子: 144
- 在线: 143小时
- 虫号: 623099
- 注册: 2008-10-11
- 性别: MM
- 专业: 光化学和辐射化学
8楼2012-02-27 10:49:58
p452_1
至尊木虫 (知名作家)
- CMEI: 7
- 应助: 456 (硕士)
- 金币: 27334.4
- 散金: 97
- 红花: 86
- 帖子: 5993
- 在线: 1895.1小时
- 虫号: 1575142
- 注册: 2012-01-12
- 性别: GG
- 专业: 无机合成和制备化学
9楼2012-02-27 16:15:27
200