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xi2004至尊木虫 (职业作家)
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虫友结构解析修正问题解答实例 已有47人参与
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不断有虫友送结构给我看，或问些问题，其中很多是重复的。 我想，还是慢慢整理在一起，放在这里， 供初学者参考。 问题1. 虫友 abcd007140 2012-2-24 问: 解晶体时 运行xprep时 出现了一段红色的提示 no acceptable space group---change tolerances or unset chiral flag or possibly change input lattice type ,then recheck cell using H-option 不知什么意思 如何处理 答： 你的这个问题，是由于该完全消光的点没有消光，导致程序不能自动判断出空间群。具体原因可能是晶体不够好，或衍射太强等。 具体到这个结构，实际上，在xprep时，可以看到 h00, 0k0, ool的点明显比其他点弱，是可以看作消光掉了。 所以结构的空间群是P2(1)2(1)2(1). 这个我能自己判断出来。 你可能还不够熟悉， 不能自己判断， 那么就要改变那个tolerances ，这个怎么做呢？ 在 xprep中，有一步是有那个 [T]选项， 你把其中那个消光判据的sigma值改为 10， 那么程序就能自动为你给出程序了，见我给你的.prp文件。 在.prp中，可见如下，其中倒数第二行，我是做了改变的： TOLERANCES CHANGED Maximum deviation (deg.) in higher symmetry cell search = 1.000 Threshold (deg.) for terminating search = 0.050 R(int) maximum for terminating cell search = 0.120 R(int) maximum for space group determination = 0.300 Minimum number of data in group for syst. absence test = 5 Maximum mean I/sigma(I) for systematic absences = 10.000 Minimum I/sigma gap between absences and rest = 5.000 |
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