24小时热门版块排行榜    

查看: 648  |  回复: 1

xudi1127

新虫 (初入文坛)

[求助] VMD 使用求助

请VMD有没有功能实现inplan rotaton?
打个比方,我的体系是一个三维盒子,盒子里面充满了原子。我现在希望看到盒子的正中央的一个平面内的原子分布情况。不知到用什么方式可以将这个平面从内部调到外部可见区域。

之前我是用atomeye来可视的,它用的shirft+mouse可以轻松实现面剪切

谢谢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
chaizhm(金币+3): 2012-02-27 22:30:51
试试这样:
比如盒字边界是{0 0 0 } {10 10 10},我现在想看x=5这个平面内的原子分布,是类似这样的情况吗?

是这样的话,很好办,
在VMD 依次点击
Graphics   —> Representations  —>  Selected Atoms  一栏里写上 x<5   ,这样x>5 的部分就隐藏了,调整方向就能看到中间平面的原子分布了。
下面示意图中就只显示了x<5的部分,调整VMD的观察角度,就能看到了,蓝色的线是模拟盒子的周期



[ Last edited by jiaoyixiong on 2012-2-24 at 08:23 ]
2楼2012-02-24 08:20:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xudi1127 的主题更新
信息提示
请填处理意见