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egogg

木虫 (小有名气)

[求助] VASP做分子动力学模拟的时候,CONTCAR文件能不能删除掉修正的部分直接使用?

以下是从vasp手册中摘录的原话:
引用回帖:
For MD-runs (IBRION=0) CONTCAR contains the actual coordinates, velocities and predictor-corrector coordinates needed as an input for the next MD-job.

现在的问题是,我能不能把速度部分(velocities)和修正部分(predictor-corrector coordinates)给删除掉,然后继续使用该文件?

我的需求是:当前分子动力学模拟的结果构形,我希望原封不同地作为下次模拟的开始构形。我发现predictor-corrector coordinates部分的数值都是相对比价大的,直接删除会不会有影响?

另外:有没有什么参数可以控制让CONTCAR输出的格式为Cartesian格式而不是Fractional格式?

谢谢!
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egogg

木虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by gavinliu7390 at 2012-02-24 14:12:25:
手动删除不就可以了吗!

这个很难, 因为vasp的算的时候也是用分数坐标计算的。  如果想要直角做标的话,只能自己写程序转了。

谢谢答复,手工删除我就怕predictor-corrector coordinates部分的影响太大,造成误差。
4楼2012-02-24 18:23:02
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2012-02-24 17:16:09
手动删除不就可以了吗!

这个很难, 因为vasp的算的时候也是用分数坐标计算的。  如果想要直角做标的话,只能自己写程序转了。
真理是一点点接近的!
3楼2012-02-24 14:12:25
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