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muxiachuixue木虫 (正式写手)
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[求助]
固定原子坐标优化出错,方法试尽,继续求助高手
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至今未解决,继续发帖求助! 课题是蛋白酶催化小分子反应过渡态的研究,我从蛋白质晶体结构里提取出氨基酸残基,加入反应物,组成初始构象,用HF/6-31g+(d,p)优化,为了使氨基酸残基在优化过程中不至于偏离晶体结构太多,我用modredundant固定了一些原子的坐标,但优化到第九步报错: Old curvilinear step not converged, using linear step Error imposing constraints Error termination via Lnk1e in /home/g09c01/g09/l103.exe at Mon Feb 20 14:13:47 2012. 以下附上我的gjf文件和out文件,问三个问题: 1.为何会报错?而且我发现我所固定的几个原子,在优化过程中相对距离发生了较小变化,并没完全固定,为何? 2.用gaussview5.0打开out文件,出现:Unresolvable inconsistency between charge and multiplicity and orbital occupancies.Orbital data will be ignored.我的电荷设为-4,自旋多重度是1,应该没错啊,怎么会如此报错? 3.用gaussview5.0打开out文件,出现:Invalid ModRedundant coordinate detected on line 180. It will be removed.请问这是为何? 此问题已困扰我多日,各种固定原子的方法我都试了,但基本上还是会出现类似的问题,求教大侠,感激不尽啊!! |
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- 附件 2 : UGT-Phenol_HF_initial1.out
2012-02-20 19:47:23, 5.11 K
2012-02-20 19:47:25, 495.57 K
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