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zhengting000新虫 (初入文坛)
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[求助]
NAMD中特殊bond定义问题
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我现在有一个疑问： 现在我要定义这样一种作用形式：体系中有A-B-C排序的原子，A-B B-C 之间只有bond作用，忽略A和B之间以及B和C之间的相互作用而单纯靠定义bond作用来约束距离，A-C之间的相互作用要忽略 在同一个体系中 我定义D-E-F，同样D-E之间 E-F之间的相互作用力忽略且单纯靠定义的bond作用来约束，但是，此时我要求A-C之间的相互作用不能忽略 NAMD能不能实现这种要求？该怎么定义实现呢？ 谢谢 |
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chenjung0825
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3楼2012-02-18 18:32:19