| 查看: 903 | 回复: 3 | ||
[求助]
请教，晶体精修时 如何把不全的配体再cif结果文件中显示出来？
|
|
审稿人提出来的意见如下，要求把配体从cif中能直接显示完全，而不是通过连接方法长全的。还请高手指点！谢谢！ Routine geometry checks show that the coordinates presented in the CIF for one of the ligands do not form a fully connected ligand set. Atoms will need to be moved togenerate a fully connected ligand |
回复此楼» 猜你喜欢
求高校合作
已经有1人回复
-
27级无机化学申博自荐
已经有2人回复
-
无机化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有204人回复
-
Chemdraw免费软件
已经有0人回复
-
单晶结构解析，各类疑难晶体数据处理和答疑
已经有38人回复
-
这个水相反应有没有催化剂促进发生
已经有4人回复
-
Mn Me3TACN
已经有5人回复
-
求助最新的CCDC数据库升级包
已经有0人回复
-
高中化学教师求助：配合物一水硫酸四氨合铜的紫外可见吸收光谱数据
已经有0人回复
-
ACS omega，返修返回去目前为in peer review，求助进度问题
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如何把cif文件中有统计的占有率不是1的原子在画图时变为一个原子
已经有6人回复
- 如何判断羧酸配体与中心原子时单齿配位还是螯合作用
已经有29人回复
- 用自然挥发法制备晶体时配体析出怎么处理?
已经有19人回复
- 【求助】请教一个CIF问题
已经有5人回复
- 【求助】我合成的一种配体，这晶体怎么就长不出来呢？
已经有17人回复
- 【请教】在checkcif中出现a和b错误，应该如何修改？
已经有5人回复
- 【请教】怎样比较各配体或金属的配位能力
已经有4人回复
- 【请教】Rietved精修中的Biso与Cif文件中的Ueq是什么关系？
已经有4人回复
- 【求助】求教对CIF文件中2个A类错误的解释
已经有8人回复
- 【分享】教你如何在CIF文件中表达氢键
已经有82人回复
p452_1
至尊木虫 (知名作家)
- CMEI: 7
- 应助: 456 (硕士)
- 金币: 27334.4
- 散金: 97
- 红花: 86
- 帖子: 5993
- 在线: 1895.1小时
- 虫号: 1575142
- 注册: 2012-01-12
- 性别: GG
- 专业: 无机合成和制备化学
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
lichun1210(金币+5): 鼓励回帖交流~，希望能帮助楼主~ 2012-02-15 08:14:11
侯丽丽2010(金币+20): ★★★很有帮助 我试试删掉再长的方法，很有效呀。谢谢 2012-02-16 11:49:58
lichun1210(金币+5): 鼓励回帖交流~，希望能帮助楼主~ 2012-02-15 08:14:11
侯丽丽2010(金币+20): ★★★很有帮助 我试试删掉再长的方法，很有效呀。谢谢 2012-02-16 11:49:58
|
Routine geometry checks show that the coordinates presented in the CIF for one of the ligands do not form a fully connected ligand set. Atoms will need to be moved togenerate a fully connected ligand 好像是说你的配体有一个形成的不够完整。你必须把配体长完整了，比如羧基上的氧可能在跟金属离子配位的位置上，为了配体的完整，你必须要把它们移到羧基的C上。一般方法有2种： 1、通过对称操作指令来搬迁这些原子，但是这种方法有时会产生比较复杂的对称操作，使得checkcif那里过不了关，产生A类问题。 2、另外一种方法就是把这些需要搬迁的原子删掉，重新精修，从长出的q峰再定出那些原子。一般那些删掉的O原子就会重新生长在配体上，这样你就会得到完整的配体了。 我不很清楚你的问题是否这样，但愿对你有所帮助。 |
2楼2012-02-15 03:08:53
3楼2012-02-15 15:30:35
p452_1
至尊木虫 (知名作家)
- CMEI: 7
- 应助: 456 (硕士)
- 金币: 27334.4
- 散金: 97
- 红花: 86
- 帖子: 5993
- 在线: 1895.1小时
- 虫号: 1575142
- 注册: 2012-01-12
- 性别: GG
- 专业: 无机合成和制备化学
4楼2012-02-15 16:15:59
