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yilanyilan

木虫 (小有名气)


[交流] 【求助】请教一个CIF问题

文章投到 inorganic chemistry, 审稿人提出:“Report the position and possible contacts of the largest electron density peak. This can be reported in _refine_special_details.” 请教各位虫友,这个问题是什么意思呢?这个位置我填的是“_refine_special_details
;
Refinement of F^2^ against ALL reflections.  The weighted R-factor wR and
goodness of fit S are based on F^2^, conventional R-factors R are based
on F, with F set to zero for negative F^2^. The threshold expression of
F^2^ > 2sigma(F^2^) is used only for calculating R-factors(gt) etc. and is
not relevant to the choice of reflections for refinement.  R-factors based
on F^2^ are statistically about twice as large as those based on F, and R-
factors based on ALL data will be even larger.
;”
我看大家也都是这么写的呢。
希望大家给点意见。
谢谢!
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hjh509

铁杆木虫 (职业作家)



yilanyilan(金币+2):谢谢参与
不是很明白!一起学习哈!
2楼2010-12-02 15:45:59
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yilanyilan(金币+2):谢谢参与
应该是解释一下最大残余密度吧
3楼2010-12-02 16:43:09
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yilanyilan

木虫 (小有名气)


我请教了专家,是关于残余电子密度的问题。单晶结构解完后,要求残余最大(+值)和最小Q(负值)峰(electron density peak)小于1。如果大于以1,要根据其位置判断是否是什么原子没有确定。比如,你的结构中如果这样的Q峰离金属只有0.5A,很显然他不可能是什么原子,其是由热振动或测试条件造成的,所以要在论文的晶体结构实验部分特殊说明。这样的残余峰有时可以通过删除坏的衍射点消除。就是在精修XL时最后一行给出的数据。the highest peak ,the minimum peak 。
4楼2010-12-04 09:54:54
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2009210721

铜虫 (著名写手)



yilanyilan(金币+2):谢谢参与
来学习,帮顶
5楼2010-12-06 18:15:55
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2009210721

铜虫 (著名写手)


过来学习下,我也遇到了类似问题
6楼2010-12-08 09:11:49
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