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cfmzxf84

木虫 (正式写手)

[求助] 求助,分子对接之后计算配体和受体结合能

我用GOLD对接好了受体和配体复合物,想用DS计算他们的结合自由能。然后通过结合自由能建模,来算EC50。
现在的问题是,普遍反应DS的MM-PBSA结果并不准确,真的很差吗?还有哪个软件比较简单易上手?
都说动力学的结果比较准确。我通过DS跑动力学,可以得到两者的自由结合能来建模吗?用哪些参数来建方程呢?
希望高手帮忙下,再次感谢
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zhouzhiguang

金虫 (小有名气)

送鲜花一朵
您好,DS的自由能计算中可以算熵变吗??
很急 谢谢
让我们high起来!
2楼2012-10-30 12:17:00
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cfmzxf84

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhouzhiguang at 2012-10-30 12:17:00
您好,DS的自由能计算中可以算熵变吗??
很急 谢谢

不太清楚,我动力学没用DS了
3楼2012-10-30 17:52:12
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