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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 已取得基因反向测序结果，要先如何处理再上blast比对？
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hotmail

木虫 (小有名气)

银虫

[求助] 已取得基因反向测序结果，要先如何处理再上blast比对？

已取得基因反向测序结果，要先如何处理再上blast比对？
是否先变为互补链，然后反转掉头，再用blast比对？谢谢。
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银虫
1楼2012-02-08 20:41:48
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steler_ly

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
任何DNA序列，不要任何处理，只要贴到NCBI里头，都会自动帮你比对出来。大胆的做吧……
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4楼2012-02-09 17:29:41
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yabxxh

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木(金币+2): 鼓励应助，多多交流哦 2012-02-09 13:42:26
这个比较难说吧，根据以前的测序结果，测序公司有时候反向引物测序，发过来就是你的序列，有时候需要反向处理，这个你还是直接拿你的测序片段和你的目的序列做一个Blast 2 Sequence，正规的话应该是一样的，如果出现不一样的情况就像你说的，反向一下，甚至可能需要反向互补一下
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2楼2012-02-09 10:01:25
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yangbin1

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
直接上blast，blast会自动的给你转换。如果非要转换很多软件都可以如 PRIMER 5，选择反向互补即可。
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3楼2012-02-09 15:37:30
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