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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » PCA分析的图看不懂 找高手来解释下
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小小佐罗2

木虫 (正式写手)

[求助] PCA分析的图看不懂 找高手来解释下已有5人参与

这个图看不懂 PC1（8.9%）是第一主成分，PC2（8.5%）为第二主成分，谁能详细解释下这2个百分数的含义。
附原文：The first two principal components explain 17.4% of variance.
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1楼2012-02-07 22:06:47
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小小佐罗2

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by yalong at 2012-09-01 16:38:40
楼主能告诉我这边文献的标题吗？

Zwielehner J, Lassl C, Hippe B, Pointner A, Switzeny OJ, et al. (2011) Changes in Human Fecal Microbiota Due to Chemotherapy Analyzed by TaqMan-
PCR, 454 Sequencing and PCR-DGGE Fingerprinting. PLoS ONE 6(12): e28654. doi:10.1371/journal.pone.0028654
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6楼2012-09-02 17:21:39
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小小佐罗2

木虫 (正式写手)
顶上去 没人知道么
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2楼2012-02-08 11:47:13
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songxc123

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
共同学习，个人认为是这样的。
主成分分析是将所有影响因子分开，通过分析，得到不同影响因子对产生变异量（差异）的贡献率。PC1指贡献率上排名第一的贡献率，是对变异量影响最大的一个因子，8.9%的贡献率，PC2就是排名第二的因子的贡献率是8.5%。
个人认为这个贡献率不是很高，一般我看了几篇文献，有的前2个主成分可以占到80%以上的贡献率。
纯属个人见解，欢迎高手指点！
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3楼2012-02-08 15:53:31
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小小佐罗2

木虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by songxc123 at 2012-02-08 15:53:31:
共同学习，个人认为是这样的。
主成分分析是将所有影响因子分开，通过分析，得到不同影响因子对产生变异量（差异）的贡献率。PC1指贡献率上排名第一的贡献率，是对变异量影响最大的一个因子，8.9%的贡献率，PC2就 ...

那我想继续请问 这2个主成分贡献率加起来才17.4%，一般要求最少要大于80%啊，这块想不明白
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4楼2012-02-08 19:15:00
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