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小小佐罗2

木虫 (正式写手)

[求助] PCA分析的图看不懂 找高手来解释下 已有5人参与

这个图看不懂 PC1(8.9%)是第一主成分,PC2(8.5%)为第二主成分,谁能详细解释下这2个百分数的含义。
附原文:The first two principal components explain 17.4% of variance.
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小小佐罗2

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by yalong at 2012-09-01 16:38:40
楼主能告诉我这边文献的标题吗?

Zwielehner J, Lassl C, Hippe B, Pointner A, Switzeny OJ, et al. (2011) Changes in Human Fecal Microbiota Due to Chemotherapy Analyzed by TaqMan-
PCR, 454 Sequencing and PCR-DGGE Fingerprinting. PLoS ONE 6(12): e28654. doi:10.1371/journal.pone.0028654
6楼2012-09-02 17:21:39
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查看全部 23 个回答

小小佐罗2

木虫 (正式写手)

顶上去 没人知道么
2楼2012-02-08 11:47:13
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songxc123

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
共同学习,个人认为是这样的。
主成分分析是将所有影响因子分开,通过分析,得到不同影响因子对产生变异量(差异)的贡献率。PC1指贡献率上排名第一的贡献率,是对变异量影响最大的一个因子,8.9%的贡献率,PC2就是排名第二的因子的贡献率是8.5%。
个人认为这个贡献率不是很高,一般我看了几篇文献,有的前2个主成分可以占到80%以上的贡献率。
纯属个人见解,欢迎高手指点!
3楼2012-02-08 15:53:31
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小小佐罗2

木虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by songxc123 at 2012-02-08 15:53:31:
共同学习,个人认为是这样的。
主成分分析是将所有影响因子分开,通过分析,得到不同影响因子对产生变异量(差异)的贡献率。PC1指贡献率上排名第一的贡献率,是对变异量影响最大的一个因子,8.9%的贡献率,PC2就 ...

那我想继续请问 这2个主成分贡献率加起来才17.4%,一般要求最少要大于80%啊,这块想不明白
4楼2012-02-08 19:15:00
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