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xiaoyingw

金虫 (小有名气)

[求助] gromacs lincs warning

我用gromacs 做md,单条链先在水中跑了5ns 的平衡后,步长是1fs, 得到相对稳定的结构,以此结构为初始结构,多条链在水中跑,步长是1fs ,可是出现too many lincs warning 然后就程序就退出了。我看了一下,每条链之间相距也不是很近,能量最小化也进行了好几次,最后也都是收敛的,这是为什么呢?请大家帮帮忙
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