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robertpeter2005

木虫 (正式写手)

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[求助] 请问大家做径向分布函数的时候结果有没有趋近于1啊？已有2人参与

请问大家做径向分布函数的三个结果，一般用哪个啊？论坛里面有人说用那个standard的，但是我发现用standard做出的图结果没有趋近于1啊，是不是不对啊？反而我用carnal.xmgr做出的图貌似结果最后是趋近于一的，难道是我做错了？看amber说明和官方邮件里面说

carnal style RDF contains un-normalized data, the
other two are normalized RDFs. The standard style RDF presumes a density
value of water unless assigned other-wise. The "volume" one is using volume
of the box to calculate the density，但是标准的并不归一啊？另外看到一些文献里面似乎都是用那个standard.xmgr做的图解释这个分布函数的，里面的值最后都没有趋近于1,这样的解释对吗？但是我在陈正隆的2007版分子模拟书里面看到径向分布函数图最后应该是趋近于1的啊？书里面应该不会错的。如果那样，那amber里面的那个standard又该怎么解释呢？另外，结果文件里面的那三行究竟是表示什么意思啊？

各位大侠，有人知道是为什么吗？还望不吝赐教啊！

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1楼2011-12-19 21:24:44

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shengxiang

木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2011-12-21 18:44:43

基本上都是趋于1的~
As long as the gas is dilute, the correlations in the positions of the atoms that g(r) takes into account are due to the potential ϕ(r) that an atom at P feels owing to the presence of an atom at O. Using the Boltzmann distribution law, If ϕ(r) were zero for all r – i.e., if the atoms did not exert any influence on each other, then g(r) = 1 for all r.