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zhengli123

金虫 (小有名气)

太多的假阳性菌落,很可能就是载体没切完全
11楼2011-12-22 20:51:07
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笔冰河

银虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by zhengli123 at 2011-12-22 20:51:07:
太多的假阳性菌落,很可能就是载体没切完全

我也觉得,挑了二三十个单克隆,总算是有一个阳性的了
12楼2011-12-23 09:54:09
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lilihuang1125

金虫 (初入文坛)

★ ★
西瓜(金币+2): 鼓励交流 2011-12-27 17:27:01
如果你的目的片段和载体的酶切是同时进行的话,目的片段切的很好,载体应该也切得没问题了。
以我的经验,如果菌落PCR有很亮的条带,最后提质粒酶切鉴定一般都是阳性的,你的条带很弱,基本就是假阳性,建议试试不同比例载体和片段的连接,我估计你是没连接上。祝顺利!

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13楼2011-12-23 11:25:40
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笔冰河

银虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by lilihuang1125 at 2011-12-23 11:25:40:
如果你的目的片段和载体的酶切是同时进行的话,目的片段切的很好,载体应该也切得没问题了。
以我的经验,如果菌落PCR有很亮的条带,最后提质粒酶切鉴定一般都是阳性的,你的条带很弱,基本就是假阳性,建议试试 ...

谢谢
14楼2011-12-26 13:38:10
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xujie158

金虫 (小有名气)

我觉得是你酶切的问题,很可能是酶切不彻底,导致生长出的都是假阳性。
你说两个酶切位点间隔很近,你可以将质粒与酶切载体产物一起电泳,一般来说在电泳是泳动是会有不同的,这样可以帮助你确定载体酶切情况,并可以对载体进行酶切。
反正从现在的结果来看,你肯定是由于载体没切好造成的,你可以加一个载体上测序的引物PCR一下,看看是不是这个原因。
15楼2011-12-27 16:41:00
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xujie158

金虫 (小有名气)

我觉得是你酶切的问题,很可能是酶切不彻底,导致生长出的都是假阳性。
你说两个酶切位点间隔很近,你可以将质粒与酶切载体产物一起电泳,一般来说在电泳是泳动是会有不同的,这样可以帮助你确定载体酶切情况,并可以对载体进行酶切后的回收。
反正从现在的结果来看,你肯定是由于载体没切好造成的,你可以加一个载体上测序的引物PCR一下,看看是不是这个原因。
16楼2011-12-27 16:42:09
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xujie158

金虫 (小有名气)

★ ★
西瓜(金币+2): 鼓励交流! 2011-12-27 17:28:02
引用回帖:
5楼: Originally posted by 青菜小虫 at 2011-12-20 10:21:54:
菌落PCR太不可靠,我一般摇菌提质粒,质粒跑电泳大小合适的话,再做酶切验证,溶液ⅠⅡⅢ都是自己配的,实验都是很麻烦,想走捷径,就有不确定性。祝实验顺利。

菌P其实一般都是没有问题的,提质粒PCR只适合做平时小量的一个验证,假如你有大量的连接要做,你基本上就不能选择提质粒之后再PCR,因为太浪费时间,另外对于一些新手,辛辛苦苦提半天再没有,更容易打消积极性。再一方面,你提质粒就能保证没有不确定性吗?其实也是未必的。
我觉得菌P具有很多优势的。两个都是很好的选择,因人和项目而异吧。
不带攻击性,只是说出自己的看法,呵呵!
17楼2011-12-27 16:48:45
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

引用回帖:
17楼: Originally posted by xujie158 at 2011-12-27 16:48:45:
菌P其实一般都是没有问题的,提质粒PCR只适合做平时小量的一个验证,假如你有大量的连接要做,你基本上就不能选择提质粒之后再PCR,因为太浪费时间,另外对于一些新手,辛辛苦苦提半天再没有,更容易打消积极性。 ...

我也赞成。菌落PCR适合大批量筛选,可以用来做第一次的筛选。挑到几个阳性克隆后,再提质粒进行酶切验证,这样鉴定出来的阳性克隆基本不会错了。
18楼2011-12-27 17:29:59
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chitty6361

新虫 (初入文坛)

你的很有可能是没有P出来,我也遇到过这种情况,加入原来体系双倍的引物和酶,我的后来就P出来了
19楼2012-02-24 11:25:29
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xiongyaoling

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 青菜小虫 at 2011-12-20 10:21:54:
菌落PCR太不可靠,我一般摇菌提质粒,质粒跑电泳大小合适的话,再做酶切验证,溶液ⅠⅡⅢ都是自己配的,实验都是很麻烦,想走捷径,就有不确定性。祝实验顺利。

菌落PCR为什么会不可靠,如果是阳性的话不就说明连上了吗?
20楼2012-05-15 16:23:58
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