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怎样用高斯优化含有两个分子的反应物?
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colinmacrean
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怎样用高斯优化含有两个分子的反应物?
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例如我要做A+B生成C的反应,在寻找A+B和C之间的过渡态的时候需要首先对A+B进行结构优化。
我的操作步骤是:将A和B一起放到GV里,然后优化结构。
但是每次优化完之后两个分子就以某种形式连接在一起了。甚至已经生成C了。
我不知道应该怎么优化这种含有两个分子的反应物?
刚开始接触高斯,不知道是否说清楚了,希望大家帮帮忙,谢谢!
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2011-12-16 15:21:09
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wanggy789
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2013-04-01 22:01:49
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chuanan027
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双分子的优化是有些难度的,你按进攻方向调两个分子构型,拉开一定距离,如果优化到一起就再拉远些。一般来说,能优化好的双分子会在微妙的弱作用力下存在。
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Timeandtidewaitfornoman.Comeon,baby!
2楼
2011-12-16 23:12:33
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xm-xi
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小木虫(金币
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你可以通过固定键长度,来优化调节距离很快就能得到初步的过渡态结构,再通过IRC完成
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wanggy789
3楼
2011-12-18 14:35:31
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colinmacrean
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专业: 可再生与替代能源利用中的
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楼
:
Originally posted by
xm-xi
at 2011-12-18 14:35:31:
你可以通过固定键长度,来优化调节距离很快就能得到初步的过渡态结构,再通过IRC完成
能否再稍微详细点呢?是固定所有键的长度么?仅调节两个分子之间的距离?
[
Last edited by colinmacrean on 2011-12-19 at 15:05
]
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4楼
2011-12-19 14:54:55
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