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janebohr

铜虫 (小有名气)

[求助] origin画电荷密度等高图

我建立了一个FM-3M空间群的晶胞，计算了它的电荷密度，然后把*cherge_frm文件里c=1的数据导入到origin里画电荷密度等高图，画出来的图就像下面那样。请各位大侠帮忙看一下这个图啥意思啊，它是001面的电荷密度等高图吗？为什么只有四个角落电荷密度最大？而且为什么这个图不对称呢？
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十年磨一剑
1楼 2011-12-13 17:03:09
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by souledge at 2011-12-14 17:05:05:
用cut3d把DEN文件转换成xsf格式，用XCrySDen打开就好了。
当然，转成V_Sim或者MoleKel等的格式也都可以用相应软件打开。
这个是Abinit的应用问题了……

怎么显示那个面呢？
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
7楼2011-12-14 19:13:32
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
janebohr(金币+1): 哦，是这样啊！我试一下，谢谢回帖 2011-12-14 10:16:20
sunyang1988(金币+3): 辛苦了 2011-12-14 17:23:19
janebohr(金币+4): 我又试了一下结构优化的时候没有转化成原胞计算，最后得到的图就正常了。谢谢大侠的提醒 2011-12-15 11:28:31
LZ应该是用的原胞计算的，三个向量夹角为60度，所以这个面应该不是001面，而是111面，而且LZ在做图时选择了夹角为90度，自然就看起来怪异了。其实调整一下矩阵坐标轴的值域范围，估计就能得到好一点的结果了～
这是对Fm-3m空间群结构原胞中111面电荷密度的计算结果（使用Abinit）：
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思想重于技巧，内涵重于表象
2楼2011-12-14 09:54:55
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janebohr

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by souledge at 2011-12-14 09:54:55:
LZ应该是用的原胞计算的，三个向量夹角为60度，所以这个面应该不是001面，而是111面，而且LZ在做图时选择了夹角为90度，自然就看起来怪异了。其实调整一下矩阵坐标轴的值域范围，估计就能得到好一点的结果了～
这 ...

我的数据是在原胞下结构优化，然后再转化回初始的晶胞分析电荷密度得到的。应该不是您说的那样，刚刚又特意重新试了一下，还是得到那个图。。。很郁闷啊！！！！
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十年磨一剑
3楼2011-12-14 11:35:32
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by souledge at 2011-12-14 09:54:55:
LZ应该是用的原胞计算的，三个向量夹角为60度，所以这个面应该不是001面，而是111面，而且LZ在做图时选择了夹角为90度，自然就看起来怪异了。其实调整一下矩阵坐标轴的值域范围，估计就能得到好一点的结果了～
这 ...

souledge ，你这个图怎么做的呀？能说一下么？
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嘟啦啦嘟啦啦嘟
4楼2011-12-14 14:32:23
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