24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3676  |  回复: 13

janebohr

铜虫 (小有名气)

[求助] origin画电荷密度等高图

我建立了一个FM-3M空间群的晶胞,计算了它的电荷密度,然后把*cherge_frm文件里c=1的数据导入到origin里画电荷密度等高图,画出来的图就像下面那样。请各位大侠帮忙看一下这个图啥意思啊,它是001面的电荷密度等高图吗?为什么只有四个角落电荷密度最大?而且为什么这个图不对称呢?
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

实验数据作图

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

十年磨一剑
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
janebohr(金币+1): 哦,是这样啊!我试一下,谢谢回帖 2011-12-14 10:16:20
sunyang1988(金币+3): 辛苦了 2011-12-14 17:23:19
janebohr(金币+4): 我又试了一下结构优化的时候没有转化成原胞计算,最后得到的图就正常了。谢谢大侠的提醒 2011-12-15 11:28:31
LZ应该是用的原胞计算的,三个向量夹角为60度,所以这个面应该不是001面,而是111面,而且LZ在做图时选择了夹角为90度,自然就看起来怪异了。其实调整一下矩阵坐标轴的值域范围,估计就能得到好一点的结果了~
这是对Fm-3m空间群结构原胞中111面电荷密度的计算结果(使用Abinit):
思想重于技巧,内涵重于表象
2楼2011-12-14 09:54:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

janebohr

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by souledge at 2011-12-14 09:54:55:
LZ应该是用的原胞计算的,三个向量夹角为60度,所以这个面应该不是001面,而是111面,而且LZ在做图时选择了夹角为90度,自然就看起来怪异了。其实调整一下矩阵坐标轴的值域范围,估计就能得到好一点的结果了~
这 ...

我的数据是在原胞下结构优化,然后再转化回初始的晶胞分析电荷密度得到的。应该不是您说的那样,刚刚又特意重新试了一下,还是得到那个图。。。很郁闷啊!!!!
十年磨一剑
3楼2011-12-14 11:35:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
2楼: Originally posted by souledge at 2011-12-14 09:54:55:
LZ应该是用的原胞计算的,三个向量夹角为60度,所以这个面应该不是001面,而是111面,而且LZ在做图时选择了夹角为90度,自然就看起来怪异了。其实调整一下矩阵坐标轴的值域范围,估计就能得到好一点的结果了~
这 ...

souledge ,你这个图怎么做的呀?能说一下么?
嘟啦啦嘟啦啦嘟
4楼2011-12-14 14:32:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

上面非应助……,忘点掉了
嘟啦啦嘟啦啦嘟
5楼2011-12-14 14:33:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
sunyang1988(金币+2): 谢谢交流 2011-12-14 17:23:59
引用回帖:
4楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-12-14 14:32:23:
souledge ,你这个图怎么做的呀?能说一下么?

用cut3d把DEN文件转换成xsf格式,用XCrySDen打开就好了。
当然,转成V_Sim或者MoleKel等的格式也都可以用相应软件打开。
这个是Abinit的应用问题了……
思想重于技巧,内涵重于表象
6楼2011-12-14 17:05:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by souledge at 2011-12-14 17:05:05:
用cut3d把DEN文件转换成xsf格式,用XCrySDen打开就好了。
当然,转成V_Sim或者MoleKel等的格式也都可以用相应软件打开。
这个是Abinit的应用问题了……

怎么显示那个面呢?
嘟啦啦嘟啦啦嘟
7楼2011-12-14 19:13:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 贺仪 at 2011-12-14 19:13:32:
怎么显示那个面呢?

刚摸出来,谢谢!
嘟啦啦嘟啦啦嘟
8楼2011-12-14 19:26:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wife332020

铁虫 (小有名气)

你好,对于cherge_frm文件我如果是想绘制(110)面的等高线图怎么做?还请指教,谢谢!!
9楼2012-07-19 21:24:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

菲顶顶

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by wife332020 at 2012-07-19 21:24:25
你好,对于cherge_frm文件我如果是想绘制(110)面的等高线图怎么做?还请指教,谢谢!!

我也想知道 你解决了吗 charge-frm文件里不是有四列数据么 是怎么筛选啊
10楼2013-04-25 21:33:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 janebohr 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +5 翩翩一书生 2026-04-09 5/250 2026-04-10 00:11 by lwk2004
[考研] 材料专硕调剂 +16 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-07 17/850 2026-04-09 21:16 by wutongshun
[考研] 284求调剂 +7 让我上岸吧阿西 2026-04-09 7/350 2026-04-09 18:59 by haironglove
[考研] 275求调剂 +5 1624447980 2026-04-08 6/300 2026-04-09 17:25 by wp06
[考研] 本科郑州大学,一志愿华东师范大学282求调剂 +23 熊哥xtk 2026-04-07 26/1300 2026-04-09 17:17 by 18446523
[考研] 一志愿西南大学生物学学硕344 求生物学相关调剂/生物与医药 +7 超人不会飞@ 2026-04-08 7/350 2026-04-09 09:35 by gong120082
[考研] 一志愿华南师范大学0702物理学305调剂 +4 念常安 2026-04-07 6/300 2026-04-08 22:53 by bljnqdcc
[考研] 347材料专硕求调剂 +18 zj8215216 2026-04-06 18/900 2026-04-08 16:27 by luoyongfeng
[考研] 264求调剂 +11 麦小叮当 2026-04-07 11/550 2026-04-08 16:05 by 一只好果子?
[考研] 280求调剂 +9 李rien 2026-04-04 9/450 2026-04-08 13:20 by lijunpoly
[考研] 326分,一志愿沪9,求生物学调剂 +4 刘墨墨 2026-04-05 4/200 2026-04-08 06:22 by lijunpoly
[考研] 求调剂 +15 熊二想上岸 2026-04-06 15/750 2026-04-08 04:53 by 无际的草原
[考研] 生物医药调剂|SCI中科院三区一作+多项科研成果 +8 likangxing 2026-04-07 11/550 2026-04-08 00:02 by lys0704
[考研] 071000生物学,一志愿深圳大学296分,求调剂 +12 TIckLw 2026-04-06 13/650 2026-04-07 20:34 by lijunpoly
[考研] 305求调剂 +4 77Qi 2026-04-06 4/200 2026-04-07 20:06 by shanqishi
[考研] 一志愿南科大生物学297分,求调剂推荐 +8 Y-yyusx 2026-04-06 9/450 2026-04-07 19:38 by biomichael
[考研] 296求调剂 +3 汪!?! 2026-04-05 4/200 2026-04-05 20:13 by 啵啵啵0119
[考研] 材料调剂 +13 一样YWY 2026-04-03 14/700 2026-04-05 18:20 by 蓝云思雨
[考研] 11408 一志愿西电,277分求调剂 +4 zhouzhen654 2026-04-03 4/200 2026-04-04 18:10 by 猪会飞
[考研] 338求调剂 +4 zzz,,r 2026-04-03 4/200 2026-04-03 16:39 by lijunpoly
信息提示
请填处理意见