24小时热门版块排行榜    

查看: 848  |  回复: 3

shiluslu

金虫 (正式写手)

[求助] 为什么cif后面加上氢键信息会出现A类错误

在cif后面加上氢键信息:
loop_
_geom_hbond_atom_site_label_D
_geom_hbond_atom_site_label_H
_geom_hbond_atom_site_label_A
_geom_hbond_distance_DH
_geom_hbond_distance_HA
_geom_hbond_distance_DA
_geom_hbond_angle_DHA
_geom_hbond_site_symmetry_A
_geom_hbond_publ_flag
#
#D   H   A   D - H  H...A   D...A    D - H...A  symm(A)
#
N3      H3A     O5          0.8600     2.0600   2.901(4)     165.00   7_645 yes
N6      H6A     O10         0.8600     2.1200   2.956(4)     164.00   7_645 yes
C5      H5A     O3          0.9300     2.5000   3.168(4)     129.00   6_456 yes

就出现了9个A类错误,这是怎么回事啊,怎么才能解决啊,哎呀,愁死了这个问题,希望高人能帮帮我啊~~~~
PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc   25.722(6), Rep    2.901(4), Dev..    3803.50 Sigma
              N3   -O5      1.555   7.645
PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc   26.535(7), Rep    2.956(4), Dev..    3368.43 Sigma
              N6   -O10     1.555   7.645
PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc   35.997(8), Rep    3.168(4), Dev..    4103.63 Sigma
              C5   -O3      1.555   6.456                                      
PLAT726_ALERT_2_A H...A   Calc    25.11000, Rep     2.06000 Dev...      23.05 Ang.
              H3A  -O5      1.555   7.645
PLAT726_ALERT_2_A H...A   Calc    26.24000, Rep     2.12000 Dev...      24.12 Ang.
              H6A  -O10     1.555   7.645                                      
PLAT726_ALERT_2_A H...A   Calc    36.28000, Rep     2.50000 Dev...      33.78 Ang.
              H5A  -O3      1.555   6.456                                      
PLAT728_ALERT_1_A D-H..A  Calc      134.00, Rep      165.00 Dev...      31.00 Deg.
              N3   -H3A  -O5      1.555   1.555   7.645      #         72      
PLAT728_ALERT_1_A D-H..A  Calc      109.00, Rep      164.00 Dev...      55.00 Deg.
              N6   -H6A  -O10     1.555   1.555   7.645      #         72      
PLAT728_ALERT_1_A D-H..A  Calc       72.00, Rep      129.00 Dev...      57.00 Deg.
              C5   -H5A  -O3      1.555   1.555   6.456      #         72
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

努力,尽力,不放弃,要放轻松,心态很重要!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wormma

木虫 (正式写手)

One for All, All for One

【答案】应助回帖

shiluslu(金币+5): 2011-12-10 18:01:38
PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc   25.722(6), Rep    2.901(4), Dev..    3803.50 Sigma
              N3   -O5      1.555   7.645

这个错误信息是说 程序计算的D-A 距离为 25.722(6)A, 而你报告的是2.901(4),二者的偏差为3803.5sigma. 可能的原因是你的对称码给错了。
也可能有其他原因,从这里看不出来。
OneforAll,AllforOne
2楼2011-12-10 00:37:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shiluslu

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wormma at 2011-12-10 00:37:46:
PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc   25.722(6), Rep    2.901(4), Dev..    3803.50 Sigma
              N3   -O5      1.555   7.645

这个错误信息是说 程序计算的D-A 距离为 25.722(6)A, 而你报告的是2 ...

应该是对称码出错了,应该怎么修改他了
努力,尽力,不放弃,要放轻松,心态很重要!
3楼2011-12-10 18:01:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wormma

木虫 (正式写手)

One for All, All for One

【答案】应助回帖

如果你用XP, 里面的envi 命令可以查到相应的对称码
OneforAll,AllforOne
4楼2011-12-11 02:40:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shiluslu 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0856材料专业298分有科研经历 硕士研究生调剂自荐信 +6 zyf上岸 2026-03-01 6/300 2026-03-01 12:43 by liqiongjy
[考研] 302材料工程求调剂 +4 Doleres 2026-03-01 5/250 2026-03-01 11:52 by liqiongjy
[考研] 321求调剂一志愿东北林业大学材料与化工英二数二 +3 虫虫虫虫虫7 2026-03-01 6/300 2026-03-01 11:50 by gaoxiaoniuma
[考研] 调剂 +3 简木ChuFront 2026-02-28 3/150 2026-03-01 11:46 by 王伟要上岸啊
[考研] 材料284求调剂,一志愿郑州大学英一数二 +7 想上岸的土拨鼠 2026-02-28 7/350 2026-03-01 11:44 by 月下best
[考研] 317一志愿华南理工电气工程求调剂 +6 Soliloquy_Q 2026-02-28 11/550 2026-03-01 11:14 by 歌liekkas
[考研] 291分工科求调剂 +7 science饿饿 2026-03-01 8/400 2026-03-01 10:43 by sunny81
[考研] 0856求调剂285 +6 吕仔龙 2026-02-28 6/300 2026-03-01 10:03 by wang_dand
[硕博家园] 博士自荐 +6 科研狗111 2026-02-26 10/500 2026-03-01 10:02 by 科研狗111
[论文投稿] 求助coordination chemistry reviews 的写作模板 10+3 ljplijiapeng 2026-02-27 4/200 2026-03-01 09:07 by babero
[考研] 298求调剂 +5 axyz3 2026-02-28 5/250 2026-03-01 06:45 by 刘兵
[考研] 285求调剂 +6 满头大汗的学生 2026-02-28 6/300 2026-03-01 06:29 by Trying]
[考研] 材料调剂 +4 爱擦汗的可乐冰 2026-02-28 4/200 2026-03-01 00:38 by 猫猫球alter
[基金申请] 面上模板改不了页边距吧? +5 ieewxg 2026-02-25 6/300 2026-03-01 00:10 by addressing
[考研] 295求调剂 +5 19171856320 2026-02-28 5/250 2026-02-28 21:39 by gaoxiaoniuma
[考研] 298求调剂 +8 人间唯你是清欢 2026-02-28 11/550 2026-02-28 20:26 by L135790
[考研] 276求调剂 +3 路lyh123 2026-02-28 4/200 2026-02-28 19:45 by 路lyh123
[考研] 0856材料求调剂 +10 hyf hyf hyf 2026-02-28 11/550 2026-02-28 18:50 by 无际的草原
[高分子] 求环氧树脂研发1名 +3 孙xc 2026-02-25 11/550 2026-02-28 16:57 by ichall
[考研] 0856调剂 +3 刘梦微 2026-02-28 3/150 2026-02-28 13:22 by houyaoxu
信息提示
请填处理意见