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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps的时间步长问题
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xiaorongwei

金虫 (初入文坛)

[交流] lammps的时间步长问题 已有10人参与

我的in文件中units 是metal 默认的时间步长是0.001ps，而我现在模拟的时间比较长，所以我将时间步长timestep提高了10倍，即0.01。建立的模型也可以跑，暂时没有出现什么异常。  不知道各位对时间步长这么大有没有什么看法，会不会对计算结果有影响？
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1楼 2011-12-09 08:17:45
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xiaorongwei

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by bay__gulf at 2011-12-11 08:42:07:
1fs 的标准是针对H原子而定的, 如果体系没有轻原子的话, 这个步长是可以加长的
lz 可以做一个小步长模拟, 找到体系的最小震动周期, 就可以确定合适的积分步长了
这个步长不宜过大, 也不宜过小

谢谢！
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10楼2011-12-11 08:57:00
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rencl1018

铜虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
chaizhm(金币+2): 谢谢交流 2011-12-09 10:31:21
chaizhm(金币+2): 谢谢交流 2011-12-09 10:31:24
Lammps里面使用的是Velocity Verlet 积分时间步长算法，较大的时间步长会使能量的涨落比较大，10fs有点大了。
赞一下(3人) 回复此楼
2楼2011-12-09 10:00:40
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chaizhm

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-12-10 20:55:41
jiaoyixiong(金币+2): 鼓励交流 2011-12-11 22:49:46
引用回帖:
1楼: Originally posted by xiaorongwei at 2011-12-09 08:17:45:
我的in文件中units 是metal 默认的时间步长是0.001ps，而我现在模拟的时间比较长，所以我将时间步长timestep提高了10倍，即0.01。建立的模型也可以跑，暂时没有出现什么异常。  不知道各位对时间步长这么大有没有 ...

不建议你通过增加时间步长的方法来提高速度。因为分子模拟用到很多数值方法对微分方程进行离散化，这样如果取的间隔太大，微积分就不满足了，系统很容易发散，对结果也会有比较大的影响
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壁立万仞，无欲则刚
3楼2011-12-09 10:33:05
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xiaorongwei

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by chaizhm at 2011-12-09 10:33:05:
不建议你通过增加时间步长的方法来提高速度。因为分子模拟用到很多数值方法对微分方程进行离散化，这样如果取的间隔太大，微积分就不满足了，系统很容易发散，对结果也会有比较大的影响

那在提高速度方面还有其他比较好的方法吗？
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4楼2011-12-09 19:30:18
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