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xiaorongwei

金虫 (初入文坛)

[交流] lammps的时间步长问题 已有10人参与

我的in文件中units 是metal 默认的时间步长是0.001ps,而我现在模拟的时间比较长,所以我将时间步长timestep提高了10倍,即0.01。建立的模型也可以跑,暂时没有出现什么异常。  不知道各位对时间步长这么大有没有什么看法,会不会对计算结果有影响?
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xiaorongwei

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by chaizhm at 2011-12-09 10:33:05:
不建议你通过增加时间步长的方法来提高速度。因为分子模拟用到很多数值方法对微分方程进行离散化,这样如果取的间隔太大,微积分就不满足了,系统很容易发散,对结果也会有比较大的影响

那在提高速度方面还有其他比较好的方法吗?
4楼2011-12-09 19:30:18
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rencl1018

铜虫 (初入文坛)

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
chaizhm(金币+2): 谢谢交流 2011-12-09 10:31:21
chaizhm(金币+2): 谢谢交流 2011-12-09 10:31:24
Lammps里面使用的是Velocity Verlet 积分时间步长算法,较大的时间步长会使能量的涨落比较大,10fs有点大了。
2楼2011-12-09 10:00:40
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chaizhm

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-12-10 20:55:41
jiaoyixiong(金币+2): 鼓励交流 2011-12-11 22:49:46
引用回帖:
1楼: Originally posted by xiaorongwei at 2011-12-09 08:17:45:
我的in文件中units 是metal 默认的时间步长是0.001ps,而我现在模拟的时间比较长,所以我将时间步长timestep提高了10倍,即0.01。建立的模型也可以跑,暂时没有出现什么异常。  不知道各位对时间步长这么大有没有 ...

不建议你通过增加时间步长的方法来提高速度。因为分子模拟用到很多数值方法对微分方程进行离散化,这样如果取的间隔太大,微积分就不满足了,系统很容易发散,对结果也会有比较大的影响
壁立万仞,无欲则刚
3楼2011-12-09 10:33:05
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chaizhm

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-12-10 20:55:38
引用回帖:
4楼: Originally posted by xiaorongwei at 2011-12-09 19:30:18:
那在提高速度方面还有其他比较好的方法吗?

你看看在体系大小方面能不能做点文章,但是体系也不能太小,因为分子模拟好多参数都是通过统计平均得到,系统太小结果也不准确
壁立万仞,无欲则刚
5楼2011-12-10 13:04:51
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