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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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秋雨子

金虫 (小有名气)

[求助] homo和lumo批量提取的脚本

最近在弄一批分子,一万个左右 ,想提取其中的homo和lumo能量值,但是发现很难实现,因为才接触脚本半年,还是自学的,所以搞不定了,有哪位大侠给个小脚本?我只会一点shell,提取个Energy还行,homo和lumo不好提取,若可以分享一下不胜感激!
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To the time to life, rather than to life in time
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asaka

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
zhou2009(金币+5): 2011-12-11 20:11:12
上面的帖子不能修改。稍微修改了一下程序,
速度快一点,另外避免了数据多于255个时python出错的情况。
CODE:
#!/bin/sh
block='Population'
eigen='eigenvalues'
occst='occ'
virst='vir'
sepst='--'
for file in $*; do
  grep "\($block\|$eigen\)" $file > tmp
  while read line; do
    case $line in
      *$block*)
        eocc='' ;
        evir='' ;;
      *$occst*)
        data=`echo $line | sed "s/^.*$sepst//"` ;
        eocc="$eocc $data" ;;
      *$virst*)
        data=`echo $line | sed "s/^.*$sepst//"` ;
        evir="$evir $data" ;;
    esac
  done < tmp
  rm tmp
  echo "File : $file"
  data=`echo $eocc | sed "s/ /,/g"`
  [ ! -z "$data" ] && echo "  HOMO :" `python -c "print max(($data))"`
  data=`echo $evir | sed "s/ /,/g"`
  [ ! -z "$data" ] && echo "  LUMO :" `python -c "print min(($data))"`
done

10楼2011-12-09 06:02:46
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查看全部 25 个回答

秋雨子

金虫 (小有名气)

没有人回复呢 ?!
To the time to life, rather than to life in time
2楼2011-12-06 14:11:26
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秋雨子

金虫 (小有名气)

3楼2011-12-07 11:23:16
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西

★ ★
小红豆(金币+2): 感谢交流。 2011-12-14 18:07:53
你先贴一个样板文件,,,,
否则谁知道你要从什么文档中提取你要的东西啊.
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
4楼2011-12-08 10:57:14
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