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cxydujuan

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[求助] 求助一个比较菜的问题：游离的水分子上的氢怎么加？

请教高人们，游离的水分子上面的氢分子怎么加啊？

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1楼 2011-11-24 22:57:40

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zhonggao18

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【答案】应助回帖

cxydujuan(金币+10): 2011-11-26 08:20:04
木瓜少爷(CMEI+1): 奖励CMEI一枚~ 2011-11-26 12:54:46

这个比较麻烦，你要是加上的氢没有受体的话就会有错误，如果是结晶水的可以不加。
要加的话，先计算一下氢键，然后Xp里面hadd加氢。
但是要在ins文件中进行键长夹角的限定。而且氢的震动参数要改成-1.5
以o1w为例
dfix 0.85 0.01 o1w h1wa
dfix 0.85 0.01 o1w h1wb
dfix 1.34 0.01 h1wa h1wb