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1楼 2011-11-24 22:57:40

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回帖置顶 ( 共有1个 )

zhonggao18

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cxydujuan(金币+10): 2011-11-26 08:20:04
木瓜少爷(CMEI+1): 奖励CMEI一枚~ 2011-11-26 12:54:46

这个比较麻烦，你要是加上的氢没有受体的话就会有错误，如果是结晶水的可以不加。
要加的话，先计算一下氢键，然后Xp里面hadd加氢。
但是要在ins文件中进行键长夹角的限定。而且氢的震动参数要改成-1.5
以o1w为例
dfix 0.85 0.01 o1w h1wa
dfix 0.85 0.01 o1w h1wb
dfix 1.34 0.01 h1wa h1wb

9楼2011-11-25 18:08:38

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zjchen

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★
lichun1210(金币+1): 感谢交流~ 2011-11-25 02:12:26
cxydujuan(金币+2): 2011-11-26 08:27:25

用dfix命令，注意键长，键角。

每天都很痛苦

2楼2011-11-24 23:53:38

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Giji521

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★
drg1984(金币+1): 欢迎来晶体版发帖交流问题！ 2011-11-25 08:44:42
cxydujuan(金币+2): 2011-11-25 15:57:14

可以把与O连接的Q峰命名为H原子，不过要根据键长判断哪个可能是O-H键，然后将其命名H 就行了

3楼2011-11-25 08:35:40

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cxydujuan

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3楼: Originally posted by Giji521 at 2011-11-25 08:35:40:
可以把与O连接的Q峰命名为H原子，不过要根据键长判断哪个可能是O-H键，然后将其命名H 就行了

想要理论加氢怎么办？

4楼2011-11-25 09:13:19

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cxydujuan

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2楼: Originally posted by zjchen at 2011-11-24 23:53:38:
用dfix命令，注意键长，键角。

是在.res文件里加上dfix命令再计算吗？这样就可以理论加氢了？我真的不太懂。还得麻烦你

5楼2011-11-25 09:15:03

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木瓜少爷(金币+1): 鼓励回帖交流～ 2011-11-25 16:19:12

引用回帖:

4楼: Originally posted by cxydujuan at 2011-11-25 09:13:19:
想要理论加氢怎么办？

直接输入HADD就好了~~

6楼2011-11-25 14:00:07

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cxydujuan

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6楼: Originally posted by Giji521 at 2011-11-25 14:00:07:
直接输入HADD就好了~~

是在.res里输入吗？

7楼2011-11-25 15:58:54

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jinhongguang

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cxydujuan(金币+5): 2011-11-26 08:19:14
cxydujuan(金币+5): 2011-11-26 08:19:51

我一般是Q峰加氢在游离水的O原子附近找两个Q峰（距离，角度适宜），然后再在RES里用DFIX限制键长，键角就可以了