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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白质同源性
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lmzxcom1

金虫 (著名写手)

[交流] 蛋白质同源性

克隆到一个酶，发表论文的时候，同源性是用蛋白质还是核酸序列。那个同源性那个百分数%是怎么算出来的，用blast中的Query coverage么？我和同源性最高的蛋白序列差异挺大的，为什么同源性却99%
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1楼 2011-11-21 14:33:28
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xzhiqiang

禁虫 (正式写手)
★
lmzxcom1(金币+1):谢谢参与
本帖内容被屏蔽
3楼2011-11-23 01:57:15
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凡子1985

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
lmzxcom1(金币+1):谢谢参与
amisking(金币+2): 鼓励发帖交流。 2011-11-21 18:32:57
引用回帖:
1楼: Originally posted by lmzxcom1 at 2011-11-21 14:33:28:
克隆到一个酶，发表论文的时候，同源性是用蛋白质还是核酸序列。那个同源性那个百分数%是怎么算出来的，用blast中的Query coverage么？我和同源性最高的蛋白序列差异挺大的，为什么同源性却99%

用蛋白序列吧 因为是酶 有时候同源序列 可能某位点蛋白质不同  但是是同类型氨基酸 所以会出现.或者：分别表示氨基酸保守和一致 同源  不一定是氨基酸相同 可以使性质相同的氨基酸
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2011-11-21 17:41:08
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