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lmzxcom1

金虫 (著名写手)

[交流] 蛋白质同源性

克隆到一个酶，发表论文的时候，同源性是用蛋白质还是核酸序列。那个同源性那个百分数%是怎么算出来的，用blast中的Query coverage么？我和同源性最高的蛋白序列差异挺大的，为什么同源性却99%

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1楼 2011-11-21 14:33:28

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凡子1985

银虫 (小有名气)

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lmzxcom1(金币+1):谢谢参与
amisking(金币+2): 鼓励发帖交流。 2011-11-21 18:32:57

引用回帖:

1楼: Originally posted by lmzxcom1 at 2011-11-21 14:33:28:
克隆到一个酶，发表论文的时候，同源性是用蛋白质还是核酸序列。那个同源性那个百分数%是怎么算出来的，用blast中的Query coverage么？我和同源性最高的蛋白序列差异挺大的，为什么同源性却99%

用蛋白序列吧因为是酶有时候同源序列可能某位点蛋白质不同但是是同类型氨基酸所以会出现.或者：分别表示氨基酸保守和一致同源不一定是氨基酸相同可以使性质相同的氨基酸