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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 审稿人意见，在MD的2ns左右有一个很小的jump，这个怎么跟他解释啊
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voleyes

银虫 (正式写手)

[求助] 审稿人意见，在MD的2ns左右有一个很小的jump，这个怎么跟他解释啊

a significant jump of distance occurs at about 2ns along the MD run. Please, explain this behavior.
It quite suspicious that such jump happens at 2ns: is this a problem with a restart file?

这是我测得某两个氨基酸之间的距离变化，我觉得这个jump很小，应该没什么问题吧，怎么跟审稿人解释呢？
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1楼 2011-11-18 02:58:34
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-11-19 11:28:23
只要保证前后的结果没有大的变化就行了
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3楼2011-11-18 08:07:54
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
zh1987hs(金币+4): 谢谢 2011-11-18 08:23:20
voleyes(金币+2): 2011-11-20 10:39:37
热波动, 很正常
毕竟这时的能量不是无穷大, 总会有比较小的概率到达这个距离的
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2楼2011-11-18 08:06:51
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voleyes

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by bay__gulf at 2011-11-18 08:06:51:
热波动, 很正常
毕竟这时的能量不是无穷大, 总会有比较小的概率到达这个距离的

但是这个怎么跟审稿人说好呢，怎么说才能让他觉得合理
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4楼2011-11-19 02:05:41
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vallen

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
voleyes(金币+4): 2011-11-20 10:39:43
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-11-21 13:03:55
可以结合其他的变化对它的影响，比如扭转角，或周围环境的作用
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5楼2011-11-19 22:30:20
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