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nnipp

金虫 (小有名气)

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[求助] 求.XYZ 文件获得任意原子距离工具

刚开始学习分子动力学
如何从.XYZ 文件获得任意原子距离
各位大侠有现成的小工具吗？
悲催，不会编程=。=“

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功不唐捐

1楼 2011-11-16 11:46:31

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

q1036210267

木虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-11-19 11:27:48
nnipp(金币+10): 谢谢用什么命令可以读取每一步坐标并计算指定某两个原子每一步的距离呢 2011-11-20 18:11:58

用fortran 很简单的编程，就是先把 xyz 文件读入,
例如有两个原子坐标分别为（x1, y1, z1）和 (x2, y2, z2)
用d = sqrt ( （x1- x2）**2 + (y1-y2)**2 + (z1-z2)**2 )，也就是数学上计算三维空间上两个点之间的距离：sqrt 是根号的意思。