24小时热门版块排行榜    

查看: 1196  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

hongyesies

金虫 (正式写手)


[交流] 计算原子配位成键时如何考虑周期性边界?

比如一个体系,盒子的空间向量为:
a1   a2   a3
b1   b2   b3
c1   c2   c3

我想编程计算配位数,需要考虑周期性边界,对于边界上的原子该如何处理呢?
我知道只要两原子距离超过盒子半长就可以做一个镜像变换来计算距离,但对于上面的向量,具体该如何编程实现?
比如计算到p(x1,y1,z1)和q(x2,y2,z2)两个原子的距离时,先要判断是否需要做镜像变换,该怎么判断,如何处理?

我画了半小时头都晕了,还请指教!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rongocean

新虫 (初入文坛)



hongyesies(金币+1):谢谢参与
任意向量的盒子,都可以有周期性边界条件
6楼2011-11-16 10:21:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

xys008

金虫 (小有名气)



hongyesies(金币+1):谢谢参与
路过支持,共同探讨。
4楼2011-11-15 20:49:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hongyesies

金虫 (正式写手)


期待高手出现……
PS.  金币就这样被水走了..
7楼2011-11-16 10:37:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gswylq

木虫 (正式写手)



hongyesies(金币+1): 谢谢参与
楼主,问题解决了吗?能否给我指点一下,计算配位数如何考虑周期性边界条件?
9楼2013-09-12 17:11:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
2011-11-15 23:08   回复  
2012-04-20 11:26   回复  
hongyesies(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
4000074楼: Originally posted by hongyesies at 2011-11-16 10:37:42: 期待高手出现…… PS. 金币就这样被水走了..

普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 YLHlRHNwYkce 2026-09-02 8/400 2026-09-03 12:05 by T0rGB46095mJ
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 YLHlRHNwYkce 2026-09-02 8/400 2026-09-03 12:03 by T0rGB46095mJ
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +9 雨打竹帘 2026-08-30 13/650 2026-09-03 08:16 by kudofaye
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +8 gdd2018 2026-08-28 13/650 2026-09-03 06:22 by 羽毛枫f
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 4/200 2026-09-03 03:14 by rM1TE0WVDIIY
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 6/300 2026-09-02 23:59 by rM1TE0WVDIIY
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +7 瞬息宇宙 2026-09-01 14/700 2026-09-02 17:33 by ma0526
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 10/500 2026-09-02 11:35 by 大不刘6
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +5 瞬息宇宙 2026-08-31 5/250 2026-09-02 10:13 by 雨冰共舞
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
信息提示
请填处理意见