24小时热门版块排行榜    

查看: 1192  |  回复: 8

hongyesies

金虫 (正式写手)


[交流] 计算原子配位成键时如何考虑周期性边界?

比如一个体系,盒子的空间向量为:
a1   a2   a3
b1   b2   b3
c1   c2   c3

我想编程计算配位数,需要考虑周期性边界,对于边界上的原子该如何处理呢?
我知道只要两原子距离超过盒子半长就可以做一个镜像变换来计算距离,但对于上面的向量,具体该如何编程实现?
比如计算到p(x1,y1,z1)和q(x2,y2,z2)两个原子的距离时,先要判断是否需要做镜像变换,该怎么判断,如何处理?

我画了半小时头都晕了,还请指教!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xys008

金虫 (小有名气)



hongyesies(金币+1):谢谢参与
路过支持,共同探讨。
4楼2011-11-15 20:49:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rongocean

新虫 (初入文坛)



hongyesies(金币+1):谢谢参与
任意向量的盒子,都可以有周期性边界条件
6楼2011-11-16 10:21:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hongyesies

金虫 (正式写手)


期待高手出现……
PS.  金币就这样被水走了..
7楼2011-11-16 10:37:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gswylq

木虫 (正式写手)



hongyesies(金币+1): 谢谢参与
楼主,问题解决了吗?能否给我指点一下,计算配位数如何考虑周期性边界条件?
9楼2013-09-12 17:11:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
ira_yuan2楼
2011-11-15 09:44   回复  
hongyesies(金币+1):谢谢参与
8399677813楼
2011-11-15 10:46   回复  
hongyesies(金币+1):谢谢参与
2011-11-15 23:08   回复  
2012-04-20 11:26   回复  
hongyesies(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
4000074楼: Originally posted by hongyesies at 2011-11-16 10:37:42: 期待高手出现…… PS. 金币就这样被水走了..

相关版块跳转 我要订阅楼主 hongyesies 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +3 瞬息宇宙 2026-08-31 6/300 2026-09-02 08:28 by 349506619
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 8/400 2026-09-02 02:42 by Leogzhya
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +4 瞬息宇宙 2026-08-31 4/200 2026-09-01 14:58 by jiaoxg
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
信息提示
请填处理意见