24小时热门版块排行榜    

查看: 693  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

chendong0625

银虫 (小有名气)

[求助] 分子动力学模拟如何设定初始距离?

例如,我要走的是碳纳米管和蛋白之间相互作用的分子动力学。
我看到文献上说的,一般设定二者中心距离为8A

我想知道,这个距离在什么地方可以设置?怎么控制
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

让我们面对现实,让我们忠于理想。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyuan8658

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-11-14 22:11:52
一般都是靠初始构象啊
2楼2011-11-14 19:06:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyuan8658

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-11-17 13:21:06
chendong0625(金币+20): 2011-11-18 10:28:29
选择一个比较合适的构象作为初始构象
控制的话,比如amber中有nmropt这个关键词,可以控制距离
4楼2011-11-17 09:08:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chendong0625 的主题更新
信息提示
请填处理意见