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voleyes

银虫 (正式写手)

[求助] 刚收到审稿意见,关于模拟的,不知道怎么改,哪位虫友帮我看一下

大致是说我这个模拟时间较短,是否达到平衡  GAFF力场是否合适这个体系

There is no discussion of whether the MD simulations are reasonably equilibrated (5 ns is a short simulation using current software and hardware).  There is no critical assessment of whether the gaff force field correctly models the behavior of the substrates.
我查看别人的文章,做的也差不多都是这么长时间啊,也都是用GAFF力场,这个要怎么跟他解释呢,需要列什么数据给他?

另外他还要求再重新做一段模拟
The authors should demonstrate that their analysis is largely independent of the initialization process of this MD run by adding at least a second 5ns run,
initialized using different seed for random velocities.

我之前已经重新做过,但是这个需要再把所有数据都列一下吗?
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xuhu_11

金虫 (职业作家)

★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-11-13 20:06:01
一定要真诚地按他要求改,实在不行就委婉地说出自己研究的软硬件条件。
千万别考博!
2楼2011-11-13 09:07:47
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