| 查看: 1201 | 回复: 2 | |||
[交流]
AMBER中小分子建立了FRCMOD,但是读入leap,依然不能保存参数 已有2人参与
|
|
我有个小分子，83个原子，用如下命令： >antecharmber -i lig.pdb -fi pdb -o lig.prepin -fo prepi -c bcc -s 2 >parmchk -i lig.prepin -f prepi -o lig.frcmod 得到frcmod以后 在Tleap中读入参数： >loadamberprep lig.prepin >loadamberparams lig.frcmod >lig =loadpdb lig.pdb 接着保存： >saveamberparm lig lig.prmtop lig.inpcrd 但是提示一大串的错误，类似： For atom: .R<**** 1>.A For atom: .R<**** 1>.A For atom: .R<**** 1>.A For atom: .R<**** 1>.A For atom: .R<**** 1>.A For atom: .R<**** 1>.A Parameter file was not saved. 请达人指教！ |
回复此楼» 猜你喜欢
0703总分331求调剂
已经有6人回复
-
085600，321分求调剂
已经有7人回复
-
325求调剂
已经有4人回复
-
085600，320分求调剂
已经有12人回复
-
一志愿0817化学工程与技术，求调剂
已经有27人回复
-
一志愿北京化工085600 310分求调剂
已经有8人回复
-
一志愿哈尔滨工业大学085600英一数二337分求调剂
已经有10人回复
-
22408求调剂 354分 可跨专业
已经有3人回复
-
277工科求调剂
已经有4人回复
-
一志愿沪9，求生物学调剂，326分
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 压膜 气泡
已经有14人回复
- 光催化剂对罗丹明B有很好的降解活性，但是对甲基橙降解活性很不好，为什么
已经有13人回复
- 碳纳米管羧基化后用什么偶联剂反应才能更好的和天然胶结合
已经有3人回复
- 那位高人指点下这三条线有什么区别，代表怎样的含义
已经有9人回复
- 关于金属钠的保存
已经有10人回复
- DNA提取求助
已经有14人回复
- 怎样比较完全地提取土壤中的微生物？
已经有15人回复
- 请问大家在低温下自由基共聚有没有什么有效提高转化率的方法啊~
已经有22人回复
- 请问这里有木有涤纶抗熔滴阻燃的大牛呢？
已经有5人回复
- 昆虫触角总RNA提取疑问
已经有12人回复
- 怎样根据下列条件在NCBI上搜索到基因序列的全长
已经有4人回复
- 有关电泳实验的问题
已经有6人回复
- 关于MVLN-assay 中对照组 荧光值背景高的问题
已经有7人回复
- 求一篇文章J. C. Phillips, Rev. Mod. Phys. 42, 317 (1970).
已经有5人回复
- 感受态的保存
已经有7人回复
- 关于表达的问题
已经有4人回复
sqfn
金虫 (正式写手)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 5486.6
- 散金: 332
- 红花: 2
- 帖子: 326
- 在线: 150小时
- 虫号: 971504
- 注册: 2010-03-15
- 性别: GG
- 专业: 生物化学
2楼2011-11-04 22:30:45
jawang
木虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 3533.7
- 散金: 43
- 红花: 1
- 帖子: 376
- 在线: 214.7小时
- 虫号: 838608
- 注册: 2009-09-02
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
3楼2011-11-05 12:51:50
