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AMBER中小分子建立了FRCMOD,但是读入leap,依然不能保存参数 已有2人参与
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我有个小分子,83个原子,用如下命令: >antecharmber -i lig.pdb -fi pdb -o lig.prepin -fo prepi -c bcc -s 2 >parmchk -i lig.prepin -f prepi -o lig.frcmod 得到frcmod以后 在Tleap中读入参数: >loadamberprep lig.prepin >loadamberparams lig.frcmod >lig =loadpdb lig.pdb 接着保存: >saveamberparm lig lig.prmtop lig.inpcrd 但是提示一大串的错误,类似: For atom: .R<**** 1>.A For atom: .R<**** 1>.A For atom: .R<**** 1>.A For atom: .R<**** 1>.A For atom: .R<**** 1>.A For atom: .R<**** 1>.A Parameter file was not saved. 请达人指教! |
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