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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 急求高手帮忙外飘水加氢。非常感谢！！！
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bqshanqi

铜虫 (小有名气)

[求助] 急求高手帮忙外飘水加氢。非常感谢！！！

怎样给外飘水加氢啊，求高手帮忙教一下。非常感谢！！！
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1楼 2011-10-31 16:27:28
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gege820530

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
木瓜少爷(金币+1): 鼓励回帖交流~ 2011-10-31 19:58:47
bqshanqi(金币+10): 谢谢 2011-11-03 10:54:18
水分子上的氢只能在残峰中找，而且如果晶体数据不好也很难找到。如果不看氢键的话，单独水分子上的氢还是别找了，也许找到氢之后还出现N个A类错误，得不偿失。
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2楼2011-10-31 18:18:54
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
木瓜少爷(金币+1): 鼓励回帖交流~ 2011-10-31 19:58:56
游离水加H纯粹是个化学概念问题。好象与一般的X衍射无关。只要懂化学中的H键定义和合理的存在模式就可以了。
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3楼2011-10-31 19:51:24
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bqshanqi

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gege820530 at 2011-10-31 18:18:54:
水分子上的氢只能在残峰中找，而且如果晶体数据不好也很难找到。如果不看氢键的话，单独水分子上的氢还是别找了，也许找到氢之后还出现N个A类错误，得不偿失。

但是不加氢会有好多A类错误啊！怎么改呢？
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4楼2011-11-01 08:19:05
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gege820530

木虫 (正式写手)
把a类错误发上来看看 才能确定怎么改。一般游离水不加氢的错误并不严重。
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5楼2011-11-01 13:41:33
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bqshanqi

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by gege820530 at 2011-11-01 13:41:33:
把a类错误发上来看看 才能确定怎么改。一般游离水不加氢的错误并不严重。

PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O1   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O2   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O3   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O6   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O7   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O8   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O9   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......        O47   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......        O48   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......        O49   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......        O50   
PLAT602_ALERT_2_A VERY LARGE Solvent Accessible VOID(S) in Structure        !
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6楼2011-11-02 08:29:29
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gege820530

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

这么多游离水？如果都是游离水不加H无所谓，只要审稿人认同你的解释就行。最后的错误是告诉你结构中还有没找到的东西。你的结构中确定只有水分子么？是不是还有其他有机溶剂没有找到？如果实在找不到就用platon的squeez处理一下吧
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7楼2011-11-02 10:31:46
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bqshanqi

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by gege820530 at 2011-11-02 10:31:46:
这么多游离水？如果都是游离水不加H无所谓，只要审稿人认同你的解释就行。最后的错误是告诉你结构中还有没找到的东西。你的结构中确定只有水分子么？是不是还有其他有机溶剂没有找到？如果实在找不到就用platon的 ...

你有platon的软件吗？我不会，能教我怎么用吗？真是太感谢了！！
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8楼2011-11-03 10:49:01
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gege820530

木虫 (正式写手)
platon 软件 资源区应该有下载 教程也应该有
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9楼2011-11-03 11:03:27
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