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bqshanqi

铜虫 (小有名气)

[求助] 急求高手帮忙外飘水加氢。非常感谢!!!

怎样给外飘水加氢啊,求高手帮忙教一下。非常感谢!!!
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gege820530

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


木瓜少爷(金币+1): 鼓励回帖交流~ 2011-10-31 19:58:47
bqshanqi(金币+10): 谢谢 2011-11-03 10:54:18
水分子上的氢只能在残峰中找,而且如果晶体数据不好也很难找到。如果不看氢键的话,单独水分子上的氢还是别找了,也许找到氢之后还出现N个A类错误,得不偿失。
2楼2011-10-31 18:18:54
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


木瓜少爷(金币+1): 鼓励回帖交流~ 2011-10-31 19:58:56
游离水加H纯粹是个化学概念问题。好象与一般的X衍射无关。只要懂化学中的H键定义和合理的存在模式就可以了。
3楼2011-10-31 19:51:24
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bqshanqi

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gege820530 at 2011-10-31 18:18:54:
水分子上的氢只能在残峰中找,而且如果晶体数据不好也很难找到。如果不看氢键的话,单独水分子上的氢还是别找了,也许找到氢之后还出现N个A类错误,得不偿失。

但是不加氢会有好多A类错误啊!怎么改呢?
4楼2011-11-01 08:19:05
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gege820530

木虫 (正式写手)

把a类错误发上来看看 才能确定怎么改。一般游离水不加氢的错误并不严重。
5楼2011-11-01 13:41:33
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bqshanqi

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by gege820530 at 2011-11-01 13:41:33:
把a类错误发上来看看 才能确定怎么改。一般游离水不加氢的错误并不严重。

PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O1   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O2   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O3   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O6   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O7   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O8   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O9   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......        O47   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......        O48   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......        O49   
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......        O50   
PLAT602_ALERT_2_A VERY LARGE Solvent Accessible VOID(S) in Structure        !
6楼2011-11-02 08:29:29
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gege820530

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

这么多游离水?如果都是游离水不加H无所谓,只要审稿人认同你的解释就行。最后的错误是告诉你结构中还有没找到的东西。你的结构中确定只有水分子么?是不是还有其他有机溶剂没有找到?如果实在找不到就用platon的squeez处理一下吧
7楼2011-11-02 10:31:46
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bqshanqi

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by gege820530 at 2011-11-02 10:31:46:
这么多游离水?如果都是游离水不加H无所谓,只要审稿人认同你的解释就行。最后的错误是告诉你结构中还有没找到的东西。你的结构中确定只有水分子么?是不是还有其他有机溶剂没有找到?如果实在找不到就用platon的 ...

你有platon的软件吗?我不会,能教我怎么用吗?真是太感谢了!!
8楼2011-11-03 10:49:01
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gege820530

木虫 (正式写手)

platon 软件 资源区应该有下载 教程也应该有
9楼2011-11-03 11:03:27
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