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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 是不是双路服务器运行gromacs不用MPI啊？
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vallen

银虫 (正式写手)

[交流] 是不是双路服务器运行gromacs不用MPI啊？ 已有1人参与

看到官网上有这么句话
As of GROMACS 4.5, threading is supported, so for e.g multi-core workstations, MPI is no longer required

上面说单机多核的就不用MPI了，那么双路服务器用吗？
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1楼 2011-10-21 16:49:22
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vallen

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jawang at 2011-10-23 13:39:18:
是的
和单机一样
使用mdrun就好了，
你可以通过看使用cpu的占用率来确定是不是已经并行了

谢谢啊
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5楼2011-10-24 10:09:14
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jawang

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-10-23 14:43:35
可以不用，他有多线程的模式运行，一样是并行的，不需要MPI
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2011-10-22 08:11:48
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vallen

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jawang at 2011-10-22 08:11:48:
可以不用，他有多线程的模式运行，一样是并行的，不需要MPI

运行效果和用MPI一样吗？

提交任务的时候就像单机一样就行了吗
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3楼2011-10-22 15:02:27
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jawang

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-10-23 14:43:45
引用回帖:
3楼: Originally posted by vallen at 2011-10-22 15:02:27:
运行效果和用MPI一样吗？

提交任务的时候就像单机一样就行了吗

是的
和单机一样
使用mdrun就好了，
你可以通过看使用cpu的占用率来确定是不是已经并行了
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4楼2011-10-23 13:39:18
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