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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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落雁双飞

银虫 (小有名气)

[求助] 请教amber中的一些问题,刚接触不太明白

我想计算一个蛋白质中两个残基链的距离,应该怎么编写相关程序呀?
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yyuan8658

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-10-20 09:39:19
落雁双飞(金币+3): 这个应该是计算的残基和具体原子之间的距离吧? 2011-10-20 18:38:10
用ptraj命令,
脚本如下
trajin md.crd
distance D1 :1@H :2@O out d1.dis

不知道是不是你想要的。
2楼2011-10-19 22:31:04
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落雁双飞

银虫 (小有名气)

这个应该是计算的原子之间的距离吧?
3楼2011-10-20 18:35:02
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