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autodock中溶剂化效应及对接后的数据处理
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请问autodock能进行溶剂化效应计算吗？如果不能，是要在对接前还是对接后考虑溶剂化效应呢？ 另外，对接完成后，cluster show中，存在最多的不是最低能量的那簇，我该选择构象最多的还是能量最低的？选择完成后，binding energy等如下图，与最终想得到的结合自由能G有什么关系，要如何转化计算？ 这些问题困扰多时，无法解决，希望帮忙解决下～～～不甚感激……  [ Last edited by suyrain on 2011-9-26 at 21:42 ] |
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