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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 新手请教几个PyMol 问题
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macromer

木虫 (小有名气)

[求助] 新手请教几个PyMol 问题

各位高手，小弟初学模拟有几个极简单PyMol的问题：
1.Autodock的对接结果能用PyMol显示吗？
2.PyMol 能显示出氢键吗？如果不行，大家如何添加氢键的？
希望高手能回答我的问题，谢谢！
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1楼 2011-09-20 20:34:56
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arthurii

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-10-09 09:15:10
1、autodock的对接结果没试过，但是autodock vina的可以，估计autodock的也可以PyMol显示，假如不是要看所有结果，完全可以用autodock tool先存pdb再读啊
2、应该可以，但没试过，找找教程吧
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-10-08 16:01:34
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ilovethis

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-10-09 09:15:17
macromer(金币+10): good 2011-10-10 23:57:06
貌似没有直接显示氢键，但是可以显示极性作用，包括了氢键，版本也有差异，0.99版的极性作用显示的不是氢键。。
可以根据对接结果测距（隐藏label）借以显示
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-10-08 16:25:16
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