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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 用Quantity one分析DGGE电泳结果，如果计算Shannon多样性指数
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laidyar

新虫 (初入文坛)

[求助] 用Quantity one分析DGGE电泳结果，如果计算Shannon多样性指数

评价微生物多样性常用的参数有：
利用Shannon多样性指数（SDI）、Pielou均匀性指数（EI）和Patrick丰富度指数（S）来评价样品的生物多样性；利用戴斯系数（Cs）评价样品之间微生物种群的相似性。
现在我做完微生物DGGE电泳后，用Quantity one 把DNA电泳泳道与条带标上后，怎样计算出这些参数（输出结果图片）

听一个学姐说从Quantity one 中能够输出一组数据，根据这组数据可以计算出这些指数，可以她已经忘记怎么做的了，哪位大写可以指导指导，我愿把我的家当都给它，虽然不多只有13金币！
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1楼 2011-09-19 10:32:49
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aslangyeah

新虫 (初入文坛)
碰到相同问题，电泳图片前期数据处理后就不知道怎么做了，高手求解！！！
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8楼2012-02-18 08:57:34
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laidyar

新虫 (初入文坛)
怎么还没有人回复啊。。。
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2楼2011-09-21 10:12:21
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)
帮顶~
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3楼2011-09-21 17:10:24
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laidyar

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 西瓜 at 2011-09-21 17:10:24:
帮顶~

版主，知道怎么做么
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4楼2011-09-22 12:45:45
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)
知道我就回帖应助啦……
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5楼2011-09-22 14:27:05
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犹寒

铁虫 (初入文坛)
我也很想知道，到底是输出哪一组呢？
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6楼2011-11-16 14:42:31
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hhz0104

金虫 (正式写手)
求解
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7楼2012-02-08 20:48:30
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DGGE

新虫 (初入文坛)
★ ★
西瓜: 金币+2, 鼓励应助 2012-04-01 17:23:00
引用回帖:
4412010楼: Originally posted by aslangyeah at 2012-02-18 08:57:34:
碰到相同问题，电泳图片前期数据处理后就不知道怎么做了，高手求解！！！

输出个条带灰度值，然后计算各条带在整个样品泳道的灰度比例
根据每个样品泳道的条带数和各条带的灰度比例，就可以计算多样性指数了。
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9楼2012-04-01 10:56:53
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木菲公6

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by DGGE at 2012-04-01 10:56:53
输出个条带灰度值，然后计算各条带在整个样品泳道的灰度比例
根据每个样品泳道的条带数和各条带的灰度比例，就可以计算多样性指数了。...

你好，请问这个条带灰度值就是条带的光密度值吗？
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10楼2013-05-11 14:37:42
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