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laidyar

新虫 (初入文坛)

[求助] 用Quantity one分析DGGE电泳结果,如果计算Shannon多样性指数

评价微生物多样性常用的参数有:
利用Shannon多样性指数(SDI)、Pielou均匀性指数(EI)和Patrick丰富度指数(S)来评价样品的生物多样性;利用戴斯系数(Cs)评价样品之间微生物种群的相似性。
现在我做完微生物DGGE电泳后,用Quantity one 把DNA电泳泳道与条带标上后,怎样计算出这些参数(输出结果图片)

听一个学姐说从Quantity one 中能够输出一组数据,根据这组数据可以计算出这些指数,可以她已经忘记怎么做的了,哪位大写可以指导指导,我愿把我的家当都给它,虽然不多只有13金币!
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aslangyeah

新虫 (初入文坛)

碰到相同问题,电泳图片前期数据处理后就不知道怎么做了,高手求解!!!
8楼2012-02-18 08:57:34
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普通回帖

laidyar

新虫 (初入文坛)

怎么还没有人回复啊。。。
2楼2011-09-21 10:12:21
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

帮顶~
3楼2011-09-21 17:10:24
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laidyar

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 西瓜 at 2011-09-21 17:10:24:
帮顶~

版主,知道怎么做么
4楼2011-09-22 12:45:45
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

知道我就回帖应助啦……
5楼2011-09-22 14:27:05
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犹寒

铁虫 (初入文坛)

我也很想知道,到底是输出哪一组呢?
6楼2011-11-16 14:42:31
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hhz0104

金虫 (正式写手)

7楼2012-02-08 20:48:30
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DGGE

新虫 (初入文坛)

★ ★
西瓜: 金币+2, 鼓励应助 2012-04-01 17:23:00
引用回帖:
4412010楼: Originally posted by aslangyeah at 2012-02-18 08:57:34:
碰到相同问题,电泳图片前期数据处理后就不知道怎么做了,高手求解!!!

输出个条带灰度值,然后计算各条带在整个样品泳道的灰度比例
根据每个样品泳道的条带数和各条带的灰度比例,就可以计算多样性指数了。
9楼2012-04-01 10:56:53
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木菲公6

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by DGGE at 2012-04-01 10:56:53
输出个条带灰度值,然后计算各条带在整个样品泳道的灰度比例
根据每个样品泳道的条带数和各条带的灰度比例,就可以计算多样性指数了。...

你好,请问这个条带灰度值就是条带的光密度值吗?
10楼2013-05-11 14:37:42
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