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sinokang至尊木虫 (职业作家)
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[求助]
Amber计算复合物中配体,受体各自的RMSD值
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跑了10ns蛋白-蛋白对接后复合物的动力学,想分别计算一下配体,受体独自的RMSD值,配体的残基序列号是1-609,受体为610-988,请问RMSD脚本应该怎样写呢? trajin .. reference .. rms first out bb.rmsd @CA, C, N time 1 |
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