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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 请教初始结构优化问题
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游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921

[求助] 请教初始结构优化问题

优化一个体系初始结构，但是始终找不到。调整下结构优化有两种情况出现：
第一种：酚羟基上的H52被羧基上O16夺去，这样的结构应该是我想要的第一步反应的后一中间体，我想要前一中间体和过渡态。图1,2
第二种：调整使H52与酰胺基上O11形成氢键，但优化完后羧基跑开，离得较远.图3,4
我调了很多次H52位置和旋转酰胺基，都不行，想要得到不被脱质子的结构，请高手指教。

附有log文件：http://3721up.com/user/controlpanel/managefile.aspx








[ 来自科研家族 木虫量化 ]
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为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能
1楼 2011-09-09 14:03:19
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游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921
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为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能
4楼2011-09-11 21:39:52
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gujing136

禁虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 2011-09-09 15:26:40
游子8921(金币+20): 2011-09-10 16:46:05
不被脱质子的结构
呃，是不是怕另外一个氧夺取质子？那么就讲这个氢与所要隔离的氧的距离放远点。
第二个方法，就是固定坐标嘛，将氢和它连接的氧的坐标固定就可以啦。
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叫老猫的兔子
2楼2011-09-09 14:39:33
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游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921
还有高手提供建议吗？
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为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能
3楼2011-09-10 16:46:12
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